RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF23P17027 643 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 CXCR1P25024 350 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 OPRM1P35372 400 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 MNAT1P51948 309 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 CARD18P57730 90 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 NCALDP61601 193 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 COPZ1P61923 177 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 PDSS1Q5T2R2 415 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 ERICH5Q6P6B1 374 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 C6orf89Q6UWU4 347 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 IL17RELQ6ZVW7 336 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 CCDC80Q76M96 950 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 BTN2A1Q7KYR7 527 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 ARPINQ7Z6K5 226 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 LUZP2Q86TE4 346 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 SLC30A8Q8IWU4 369 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 SLC26A7Q8TE54 656 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 ABHD3Q8WU67 409 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 TMED6Q8WW62 240 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 CCL19Q99731 98 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 ARHGDIGQ99819 225 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 RNF122Q9H9V4 155 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 ELOVL5Q9NYP7 299 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 ADA2Q9NZK5 511 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 ABCD2Q9UBJ2 740 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF175Q9Y473 711 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 ROS1P08922 2347 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 RNF212BA8MTL3 300 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 F8VVB4 439 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 F8VWA3 439 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 H3BNX3 289 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 SULT2B1O00204 365 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 CXCR6O00574 342 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 CRLF1O75462 422 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 ATP5HO75947 161 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 LGI1O95970 557 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 OR1E2P47887 323 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 GUSBP1Q15486 140 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 OR1Q1Q15612 314 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 TWIST1Q15672 202 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 NRF1Q16656 503 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 ZSWIM7Q19AV6 140 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 CYBRD1Q53TN4 286 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 TMPPEQ6ZT21 453 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 FCRLAQ7L513 359 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 DEFB107AQ8IZN7 70 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 OR52E4Q8NGH9 312 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 OR6T1Q8NGN1 323 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 SLC35B4Q969S0 331 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 DDIT4LQ96D03 193 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 STARD4Q96DR4 205 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 TPD52L3Q96J77 140 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 ZFP3Q96NJ6 502 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 MCHR1Q99705 422 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 SFXN3Q9BWM7 321 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 UBTD1Q9HAC8 227 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 KLHL28Q9NXS3 571 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 ACTR3BQ9P1U1 418 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM181Q9P2C4 612 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa6.56□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa6.55□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 A0A0B4J203 849 aa6.55□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 A0A0B4J2E0 115 aa6.55□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 A0A1B0GX12 115 aa6.55□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 CASKO14936 926 aa6.55□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF208O43345 1280 aa6.55□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 RAMP1O60894 148 aa6.55□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF682O95780 498 aa6.55□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 SERPINA1P01009 418 aa6.55□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 THY1P04216 161 aa6.55□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 T-ENOLP0DO92 83 aa6.55□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 AHCYP23526 432 aa6.55□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 AGTR1P30556 359 aa6.55□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 KDELR2P33947 212 aa6.55□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 OR2B6P58173 313 aa6.55□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 CEACAM7Q14002 265 aa6.55□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 OR7A5Q15622 319 aa6.55□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 ZSCAN26Q16670 478 aa6.55□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 C1orf140Q5VVS0 124 aa6.55□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 OR2A2Q6IF42 318 aa6.55□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 CCDC121Q6ZUS5 278 aa6.55□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 VTCN1Q7Z7D3 282 aa6.55□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 CARM1Q86X55 608 aa6.55□□□□□ -1.36
ATG4D-210ENST00000588972 PHC2Q8IXK0 858 aa6.55□□□□□ -1.36
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