RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586813.5

TRAF4-216, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-216ENST00000586813 WFDC12Q8WWY7 111 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF799Q96GE5 643 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 MAP6Q96JE9 813 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 SLC22A4Q9H015 551 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 MARCH7Q9H992 704 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 NOX4Q9NPH5 578 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 RNF7Q9UBF6 113 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 KCNG2Q9UJ96 466 aa16.08■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 A0A1B0GUS0 222 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 CD300LBA8K4G0 201 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 OR10H3O60404 316 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 GMNNO75496 209 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 RAG2P55895 527 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 DEFA6Q01524 100 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 SNAI3Q3KNW1 292 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF620Q6ZNG0 422 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 RNF148Q8N7C7 305 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 OR4F5Q8NH21 305 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 SPTSSAQ969W0 71 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 CMTM5Q96DZ9 223 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 GORASP2Q9H8Y8 452 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 TNFRSF19Q9NS68 423 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 ADA2Q9NZK5 511 aa16.07■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF879B4DU55 563 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 LGALS8O00214 317 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 P2RY10O00398 339 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 IDH3BO43837 385 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 KNG1P01042 644 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 MMP9P14780 707 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 GSSP48637 474 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF92Q03936 586 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 CD276Q5ZPR3 534 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 OR2AE1Q8NHA4 323 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 PYURFQ96I23 114 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 TBX15Q96SF7 602 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 CHIAQ9BZP6 476 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 BEX1Q9HBH7 125 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 SMURF1Q9HCE7 757 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 KIF17Q9P2E2 1029 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 ERVK-18Q9QC07 812 aa16.06■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 C3orf80F5H4A9 247 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 GMDSO60547 372 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 TOX4O94842 621 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 CRYBA1P05813 215 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 LIPFP07098 398 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 MELTFP08582 738 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF823P16415 610 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 ANOS1P23352 680 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 IFNGR2P38484 337 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 RPS27P42677 84 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 RELBQ01201 579 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP16.05■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 OR8B8Q15620 311 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 C17orf107Q6ZR85 190 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 TMEM86BQ8N661 226 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 KIR3DL3Q8N743 410 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 PLPP7Q8NBV4 271 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 TRIM36Q9NQ86 728 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF446Q9NWS9 450 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 C1RLQ9NZP8 487 aa16.05■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 OOEPA6NGQ2 149 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 GGT3PA6NGU5 568 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 ADAM20O43506 726 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 NDUFA7O95182 113 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 PSKH1P11801 424 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 RRM2P31350 389 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 PYCR1P32322 319 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 TSPAN31Q12999 210 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 GLYATL3Q5SZD4 288 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 PROKR2Q8NFJ6 384 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 GATAD2BQ8WXI9 593 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 MCUR1Q96AQ8 359 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 WDFY2Q96P53 400 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 MYLK2Q9H1R3 596 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 TGP01266 2768 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 VWFP04275 2813 aa16.04■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 C5orf63A6NC05 138 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 NDUFA2O43678 99 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 OCLNQ16625 522 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 MIDNQ504T8 468 aa16.03■□□□□ 0.16
TRAF4-216ENST00000586813 METTL11BQ5VVY1 283 aa16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms