RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575176.5

SMG6-216, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, humanhuman

TSL 4

Gene SMG6, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6-216ENST00000575176 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 A8MV72 311 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 VSTM5A8MXK1 200 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 F5H5P2 479 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 J3QRE1 110 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 HLA-DPB1P04440 258 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 HMGN1P05114 100 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 ZNF823P16415 610 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 LIPAP38571 399 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 CD200P41217 278 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 CX3CR1P49238 355 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 PRKXP51817 358 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 CHN2P52757 468 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 BLVRAP53004 296 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 TMEM33P57088 247 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 ISL1P61371 349 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 FAM3AP98173 230 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 ROM1Q03395 351 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 ZMYND11Q15326 602 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 ZNF684Q5T5D7 378 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 NXNL2Q5VZ03 156 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 ARL9Q6T311 187 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 CCDC121Q6ZUS5 278 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 SPATC1Q76KD6 591 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 BHLHE23Q8NDY6 225 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 OR2Z1Q8NG97 314 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 OR8B12Q8NGG6 310 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 Q8TCH9 128 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 COG8Q96MW5 612 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 DIRC2Q96SL1 478 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 TEAD3Q99594 435 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 SLC29A1Q99808 456 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 COPS4Q9BT78 406 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 ZNF556Q9HAH1 456 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 HAO2Q9NYQ3 351 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 TVP23BQ9NYZ1 205 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 TREM2Q9NZC2 230 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 KIF17Q9P2E2 1029 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 IL19Q9UHD0 177 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 LRP12Q9Y561 859 aa7.3□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 PLSCR5A0PG75 271 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 CD300LBA8K4G0 201 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 A8MXK9 166 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 PNPP00491 289 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 AVPP01185 164 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 FSHBP01225 129 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 MT-ND5P03915 603 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 LCATP04180 440 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 LYNP07948 512 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 GZMKP49863 264 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 TPTEP56180 551 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 GRB2P62993 217 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 PAX2Q02962 417 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 MPPED2Q15777 294 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 SNAPC1Q16533 368 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 ZNF181Q2M3W8 571 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 ZMAT1Q5H9K5 638 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 CYB5R2Q6BCY4 276 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 ZFP1Q6P2D0 407 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 LRRN1Q6UXK5 716 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 Q6ZSR3 168 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 IL17RELQ6ZVW7 336 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 SLC16A9Q7RTY1 509 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 TCEANCQ8N8B7 351 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 ZNF540Q8NDQ6 660 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 OR56B2PQ8NGI1 322 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 HPSE2Q8WWQ2 592 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 UBE2FQ969M7 185 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 SPTSSAQ969W0 71 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 SGK3Q96BR1 496 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 HRASLS5Q96KN8 279 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 OR8B4Q96RC9 309 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 ZNF649Q9BS31 505 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 TOR3AQ9H497 397 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 NARFLQ9H6Q4 476 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 ZNF665Q9H7R5 613 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 S100A14Q9HCY8 104 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 TMEM106BQ9NUM4 274 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 GPR160Q9UJ42 338 aa7.29□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa7.28□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 CLDN25C9JDP6 229 aa7.28□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 TMEM178BH3BS89 294 aa7.28□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 EBAG9O00559 213 aa7.28□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMG6-216ENST00000575176 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
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