RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 C5orf63A6NC05 138 aa28.29■■■□□ 2.12
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF85Q03923 595 aa28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 GLYATL3Q5SZD4 288 aa28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2AE1Q8NHA4 323 aa28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 OPA3Q9H6K4 179 aa28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 CYSLTR2Q9NS75 346 aa28.29■■■□□ 2.12
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CTDNEP1-209ENST00000574205 C17orf100A8MU93 164 aa28.27■■■□□ 2.12
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZMAT1Q5H9K5 638 aa28.27■■■□□ 2.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2T2Q6IF00 324 aa28.27■■■□□ 2.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 YIPF7Q8N8F6 280 aa28.27■■■□□ 2.12
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TPK1Q9H3S4 243 aa28.27■■■□□ 2.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 INPP5EQ9NRR6 644 aa28.27■■■□□ 2.12
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF319Q9P2F9 582 aa28.27■■■□□ 2.12
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CTDNEP1-209ENST00000574205 METTL15A6NJ78 407 aa28.26■■■□□ 2.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 F12P00748 615 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF81P51508 661 aa28.26■■■□□ 2.11
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PRSS57Q6UWY2 283 aa28.26■■■□□ 2.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR52I1Q8NGK6 324 aa28.26■■■□□ 2.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 RGCCQ9H4X1 137 aa28.26■■■□□ 2.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 IQCF6A8MYZ5 107 aa28.25■■■□□ 2.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 TESK1Q15569 626 aa28.25■■■□□ 2.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q5PR19 223 aa28.25■■■□□ 2.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 LAIR2Q6ISS4 152 aa28.25■■■□□ 2.11
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa28.23■■■□□ 2.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 ERVK13-1Q9NX77 482 aa28.23■■■□□ 2.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa28.23■■■□□ 2.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa28.22■■■□□ 2.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM20BO75063 409 aa28.22■■■□□ 2.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPP14O95059 124 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 TACSTD2P09758 323 aa28.22■■■□□ 2.11
CTDNEP1-209ENST00000574205 GFOD2Q3B7J2 385 aa28.22■■■□□ 2.11
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