RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572043.5

CTDNEP1-207, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-207ENST00000572043 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa14.97□□□□□ -0.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 OCEL1Q9H607 264 aa14.97□□□□□ -0.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 NTN4Q9HB63 628 aa14.97□□□□□ -0.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa14.97□□□□□ -0.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 CUBNO60494 3623 aa14.97□□□□□ -0.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 JMJD1CQ15652 2540 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 A0A0G2JMP0 313 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 A0A0X1KG70 313 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 CD300LBA8K4G0 201 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 SELENOFO60613 162 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 AVPP01185 164 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 HSD11B1P28845 292 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 CX3CR1P49238 355 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 RPS7P62081 194 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 FAM201AQ5SY85 155 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 DCAF12L2Q5VW00 463 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 CPOQ8IVL8 374 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 KLHL36Q8N4N3 616 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 SPICQ8N5J4 248 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 BBS1Q8NFJ9 593 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR4M2Q8NGB6 313 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 PLEKHA8Q96JA3 519 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 AMELYQ99218 206 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 ABHD6Q9BV23 337 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 BRD7Q9NPI1 651 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 UFSP2Q9NUQ7 469 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 METRNQ9UJH8 293 aa14.96□□□□□ -0.01
CTDNEP1-207ENST00000572043 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa14.95□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 HMGN1P05114 100 aa14.95□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 ADRA2CP18825 462 aa14.95□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 THBS2P35442 1172 aa14.95□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 PMELP40967 661 aa14.95□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC15A1P46059 708 aa14.95□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 RAD23AP54725 363 aa14.95□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 GRB2P62993 217 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 CDK5Q00535 292 aa14.95□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 MAB21L1Q13394 359 aa14.95□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR8G1Q15617 311 aa14.95□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 TIGD4Q8IY51 512 aa14.95□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 C19orf18Q8NEA5 215 aa14.95□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa14.95□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 MDH2P40926 338 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 RASSF2P50749 326 aa14.94□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 GFOD2Q3B7J2 385 aa14.94□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 TMEM155Q4W5P6 130 aa14.94□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 C1orf146Q5VVC0 180 aa14.94□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 FAM57BQ71RH2 274 aa14.94□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR56B2PQ8NGI1 322 aa14.94□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 SPATA3Q8NHX4 192 aa14.94□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 THEM6Q8WUY1 208 aa14.94□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 MMP26Q9NRE1 261 aa14.94□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 TVP23BQ9NYZ1 205 aa14.94□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 LRRC30A6NM36 301 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 CEACAM18A8MTB9 384 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 TCF21O43680 179 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 MITFO75030 526 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 FOXH1O75593 365 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 H2BFMP0C1H6 154 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 IRF2P14316 349 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 DAPP51397 102 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 MPPED2Q15777 294 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 SNAPC1Q16533 368 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 TIGD6Q17RP2 521 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 SHFQ7M4L6 423 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 RFLNBQ8N5W9 214 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR5K1Q8NHB7 308 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 RNF133Q8WVZ7 376 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 TEX12Q9BXU0 123 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 C7orf69Q9H7B7 122 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 MARCH7Q9H992 704 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC25A19Q9HC21 320 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 A0A1B0GWJ7 208 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 IFNL4K9M1U5 179 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 XRCC2O43543 280 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 FAM20BO75063 409 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 ATP5HO75947 161 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 LYNP07948 512 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 CD200P41217 278 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 CRISP1P54107 249 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 ATP6AP1Q15904 470 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 LIPNQ5VXI9 398 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 FAHD1Q6P587 224 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms