RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566784.5

PKD1-231, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-231	ENST00000566784	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	TOR3A	Q9H497	397 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	OPA3	Q9H6K4	179 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	NTN4	Q9HB63	628 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	CENPM	Q9NSP4	180 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	CD300LB	A8K4G0	201 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	PPIAL4D	F5H284	164 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	PRODH	O43272	600 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	XRCC2	O43543	280 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	FOXH1	O75593	365 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	FSTL3	O95633	263 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	CPT2	P23786	658 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	CD200	P41217	278 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	PRKX	P51817	358 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	PRSS12	P56730	875 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF92	Q03936	586 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	SCGB2A2	Q13296	93 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	TIGD4	Q8IY51	512 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	ERGIC1	Q969X5	290 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	OTULIN	Q96BN8	352 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	TEX12	Q9BXU0	123 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	METRN	Q9UJH8	293 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PKD1-231	ENST00000566784	LRRC30	A6NM36	301 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	TIPRL	O75663	272 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	APOC1	P02654	83 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	HLA-DPB1	P04440	258 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	ANOS1	P23352	680 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	MAB21L1	Q13394	359 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	FAHD1	Q6P587	224 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	PHC2	Q8IXK0	858 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	PARP8	Q8N3A8	854 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784		Q8TCH9	128 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	SPSB4	Q96A44	273 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	ABHD6	Q9BV23	337 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	SP140L	Q9H930	580 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	C5orf63	A6NC05	138 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	GGT3P	A6NGU5	568 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784		A8MXK9	166 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	TCF21	O43680	179 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	GMDS	O60547	372 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	SLC2A1	P11166	492 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	CA6	P23280	308 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	HSD11B1	P28845	292 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	OPRL1	P41146	370 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	CX3CR1	P49238	355 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	CRISP1	P54107	249 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	RAD23A	P54725	363 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	LCN2	P80188	198 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	ATP6AP1	Q15904	470 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	LIPN	Q5VXI9	398 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	SPATC1	Q76KD6	591 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	KLB	Q86Z14	1044 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	CPO	Q8IVL8	374 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PKD1-231	ENST00000566784	OTOS	Q8NHW6	89 aa		11.63	□□□□□ -0.55

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