RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		16.34	■□□□□ 0.21
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		16.34	■□□□□ 0.21
RRN3-205	ENST00000563559	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		16.34	■□□□□ 0.21
RRN3-205	ENST00000563559	OR6X1	Q8NH79	312 aa		16.34	■□□□□ 0.21
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	16.34	■□□□□ 0.21
RRN3-205	ENST00000563559	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		16.34	■□□□□ 0.21
RRN3-205	ENST00000563559	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		16.34	■□□□□ 0.21
RRN3-205	ENST00000563559	SHD	Q96IW2	340 aa		16.34	■□□□□ 0.21
RRN3-205	ENST00000563559	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		16.34	■□□□□ 0.21
RRN3-205	ENST00000563559	CST11	Q9H112	138 aa		16.34	■□□□□ 0.21
RRN3-205	ENST00000563559	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	16.34	■□□□□ 0.21
RRN3-205	ENST00000563559	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	16.33	■□□□□ 0.21
RRN3-205	ENST00000563559	GNB3	P16520	340 aa		16.33	■□□□□ 0.21
RRN3-205	ENST00000563559	HRH1	P35367	487 aa		16.33	■□□□□ 0.21
RRN3-205	ENST00000563559	CD96	P40200	585 aa		16.33	■□□□□ 0.21
RRN3-205	ENST00000563559	CASR	P41180	1078 aa		16.33	■□□□□ 0.21
RRN3-205	ENST00000563559	TAS2R31	P59538	309 aa		16.33	■□□□□ 0.21
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R1A	Q13522	171 aa		16.33	■□□□□ 0.21
RRN3-205	ENST00000563559	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		16.33	■□□□□ 0.21
RRN3-205	ENST00000563559	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		16.33	■□□□□ 0.21
RRN3-205	ENST00000563559	TDH	Q8IZJ6	230 aa		16.33	■□□□□ 0.21
RRN3-205	ENST00000563559	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		16.33	■□□□□ 0.21
RRN3-205	ENST00000563559	PXT1	Q8NFP0	134 aa		16.33	■□□□□ 0.21
RRN3-205	ENST00000563559	POC1B	Q8TC44	478 aa		16.33	■□□□□ 0.21
RRN3-205	ENST00000563559	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		16.33	■□□□□ 0.21
RRN3-205	ENST00000563559	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		16.33	■□□□□ 0.21
RRN3-205	ENST00000563559	RARRES3	Q9UL19	164 aa		16.33	■□□□□ 0.21
RRN3-205	ENST00000563559	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	16.33	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	BCL2L11	O43521	198 aa		16.33	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	ONECUT2	O95948	504 aa		16.33	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	OR52W1	Q6IF63	320 aa		16.33	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	16.33	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	16.33	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		16.33	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		16.33	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	OXGR1	Q96P68	337 aa		16.33	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		16.33	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	RASL12	Q9NYN1	266 aa		16.33	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		16.33	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	16.32	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	16.32	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	16.32	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	16.32	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	PTGDS	P41222	190 aa		16.32	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	16.32	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	P2RY4	P51582	365 aa		16.32	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	STARD6	P59095	220 aa		16.32	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	FOXK1	P85037	733 aa		16.32	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	KCNMB1	Q16558	191 aa		16.32	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	ACTBL2	Q562R1	376 aa		16.32	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		16.32	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	COMMD2	Q86X83	199 aa		16.32	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		16.32	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	THAP6	Q8TBB0	222 aa		16.32	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		16.32	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		16.32	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	OR2J2	O76002	312 aa		16.31	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	NR2C1	P13056	603 aa		16.31	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	ADH6	P28332	368 aa		16.31	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	STAR	P49675	285 aa		16.31	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	PRKX	P51817	358 aa		16.31	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	16.31	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		16.31	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	16.31	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	OR5B2	Q96R09	309 aa		16.31	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	16.31	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		16.31	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	16.31	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	16.31	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		16.31	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		16.31	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		16.31	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		16.31	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF726	A6NNF4	738 aa		16.31	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	16.31	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	CYC1	P08574	325 aa		16.31	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF43	P17038	809 aa		16.31	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	DLST	P36957	453 aa		16.31	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		16.31	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		16.31	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	16.31	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	OR2M3	Q8NG83	312 aa		16.31	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	OR4K15	Q8NH41	348 aa		16.31	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	ST8SIA4	Q92187	359 aa		16.31	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	CRB3	Q9BUF7	120 aa		16.31	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		16.31	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		16.31	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		16.31	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	EFS	O43281	561 aa		16.3	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	TIAF1	O95411	115 aa		16.3	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	CCL1	P22362	96 aa		16.3	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	16.3	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	16.3	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	16.3	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		16.3	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	DOK3	Q7L591	496 aa		16.3	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		16.3	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	RAB3C	Q96E17	227 aa		16.3	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	16.3	■□□□□ 0.2
RRN3-205	ENST00000563559	SEC22A	Q96IW7	307 aa		16.3	■□□□□ 0.2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms