RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		18.29	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNJ15	Q99712	375 aa		18.29	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	18.29	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	MED20	Q9H944	212 aa		18.29	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	MARCH7	Q9H992	704 aa		18.29	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	POMP	Q9Y244	141 aa		18.29	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200		H3BN98	237 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	FOXH1	O75593	365 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	FSTL3	O95633	263 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	TEX29	Q8N6K0	151 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	COPS4	Q9BT78	406 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM165	Q9HC07	324 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	CD300LB	A8K4G0	201 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200		A8MXK9	166 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	GNGT2	O14610	69 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	CD200	P41217	278 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	MMP26	Q9NRE1	261 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PPP4C-205	ENST00000563200	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF878	C9JN71	531 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	FKBP6	O75344	327 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	FSHB	P01225	129 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	ADRA2C	P18825	462 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	PRKX	P51817	358 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	RAD23A	P54725	363 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	GINS1	Q14691	196 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	SPATA24	Q86W54	205 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200		Q8TCH9	128 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	OCEL1	Q9H607	264 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	NTN4	Q9HB63	628 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	CENPM	Q9NSP4	180 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A0A6YYJ9	748 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	GLCE	O94923	617 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	VENTX	O95231	258 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	WNT2	P09544	360 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC2A1	P11166	492 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	OSM	P13725	252 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	PRKACG	P22612	351 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	GSTT1	P30711	240 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	CBX1	P83916	185 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	CDK5	Q00535	292 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	SCGB2A2	Q13296	93 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	TIGD4	Q8IY51	512 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	ERGIC1	Q969X5	290 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	SPSB4	Q96A44	273 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	INTS14	Q96SY0	518 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC22A4	Q9H015	551 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	YY1AP1	Q9H869	796 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	GSC2	O15499	205 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	E2F6	O75461	281 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF205	O95201	554 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	EPHA1	P21709	976 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	CA6	P23280	308 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	CPT2	P23786	658 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	POU1F1	P28069	291 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	BNIP1	Q12981	228 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	TAF13	Q15543	124 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	SPATC1	Q76KD6	591 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	AMELY	Q99218	206 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	ABHD6	Q9BV23	337 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC30	A6NM36	301 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC15A1	P46059	708 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	MPPED2	Q15777	294 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF404	Q494X3	552 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM201A	Q5SY85	155 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	NANP	Q8TBE9	248 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	GMDS	O60547	372 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	ANXA8	P13928	327 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF12	P17014	697 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	OPRL1	P41146	370 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	PAX2	Q02962	417 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PPP4C-205	ENST00000563200	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		18.23	■□□□□ 0.51

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