RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563065.5

CCNDBP1-204, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,450 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF679Q8IYX0 411 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 ASB17Q8WXJ9 295 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 SGK3Q96BR1 496 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 LGALS12Q96DT0 336 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 MROQ9BYG7 248 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 GPR160Q9UJ42 338 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 PLSCR5A0PG75 271 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 J3QRE1 110 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 OR2T7P0C7T2 308 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 DBTP11182 482 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 DAOP14920 347 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 COL8A2P25067 703 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 ISL1P61371 349 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF85Q03923 595 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 CARTPTQ16568 116 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 GFOD2Q3B7J2 385 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 C6orf52Q5T4I8 152 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 PGAP1Q75T13 922 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 OR2T27Q8NH04 317 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 PGAM5Q96HS1 289 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 VCXQ9H320 206 aa14.86□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 H0YL77 283 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 PNPP00491 289 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 RIPK1Q13546 671 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 DEGS2Q6QHC5 323 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 TFAP2CQ92754 450 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 Q96MT0 163 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 MNTQ99583 582 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 SOX7Q9BT81 388 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 FAM206AQ9NX38 181 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 MYRFQ9Y2G1 1151 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 ACANP16112 2415 aa14.85□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 H0YAE9 185 aa14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 PHYHO14832 338 aa14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 APOC1P02654 83 aa14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 RIDAP52758 137 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF684Q5T5D7 378 aa14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 OR8G5Q8NG78 346 aa14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 OR2Z1Q8NG97 314 aa14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 OR8B12Q8NGG6 310 aa14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 REEP6Q96HR9 211 aa14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 LYZL4Q96KX0 146 aa14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 TREM2Q9NZC2 230 aa14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 SNTNA6NMZ2 147 aa14.83□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 CD300LBA8K4G0 201 aa14.83□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 IQCF6A8MYZ5 107 aa14.83□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 CDC14BO60729 498 aa14.83□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF254O75437 659 aa14.83□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 RPP14O95059 124 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 MT-ND5P03915 603 aa14.83□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 HLA-DPB1P04440 258 aa14.83□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 EGR3Q06889 387 aa14.83□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 CDK5R2Q13319 367 aa14.83□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 TIGD6Q17RP2 521 aa14.83□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 TP53I3Q53FA7 332 aa14.83□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 LAIR2Q6ISS4 152 aa14.83□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 YIPF7Q8N8F6 280 aa14.83□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa14.83□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 UBASH3BQ8TF42 649 aa14.83□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 FAM168AQ92567 244 aa14.83□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 YIPF5Q969M3 257 aa14.83□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 SPSB4Q96A44 273 aa14.83□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 RHNO1Q9BSD3 238 aa14.83□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 OR10A2Q9H208 303 aa14.83□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 NIPAL2Q9H841 368 aa14.83□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 CYSLTR2Q9NS75 346 aa14.83□□□□□ -0.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 F8P00451 2351 aa14.83□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 DAPL1A0PJW8 107 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 GGT3PA6NGU5 568 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 RNF223E7ERA6 249 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 H7C1Q1 480 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 XRCC2O43543 280 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 LIPAP38571 399 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 FAM3AP98173 230 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 CLEC2AQ6UVW9 174 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 LHFPL3Q86UP9 236 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 SETD9Q8NE22 299 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 OR10AD1Q8NGE0 317 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 OR52H1Q8NGJ2 320 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 OR52I1Q8NGK6 324 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms