RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558324.1

HERC1-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, humanhuman

TSL 5

Gene HERC1, Length 828 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1-202ENST00000558324 TRAPPC2LH3BP13 241 aa10□□□□□ -0.81
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HERC1-202ENST00000558324 GNGT2O14610 69 aa10□□□□□ -0.81
HERC1-202ENST00000558324 ACOT8O14734 319 aa10□□□□□ -0.81
HERC1-202ENST00000558324 CST1P01037 141 aa10□□□□□ -0.81
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HERC1-202ENST00000558324 POU1F1P28069 291 aa10□□□□□ -0.81
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HERC1-202ENST00000558324 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HERC1-202ENST00000558324 HS3ST5Q8IZT8 346 aa9.99□□□□□ -0.81
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HERC1-202ENST00000558324 OR51V1Q9H2C8 321 aa9.98□□□□□ -0.81
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HERC1-202ENST00000558324 A6NLC8 198 aa9.97□□□□□ -0.81
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HERC1-202ENST00000558324 TRIM77I1YAP6 450 aa9.97□□□□□ -0.81
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HERC1-202ENST00000558324 PAICSP22234 425 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
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HERC1-202ENST00000558324 SLC15A1P46059 708 aa9.97□□□□□ -0.81
HERC1-202ENST00000558324 BLVRAP53004 296 aa9.97□□□□□ -0.81
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