RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557667.5

RBM23-233, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 1 (best)

Gene RBM23, Length 4,240 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-233	ENST00000557667	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
RBM23-233	ENST00000557667	NAA40	Q86UY6	237 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RBM23-233	ENST00000557667	MKX	Q8IYA7	352 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RBM23-233	ENST00000557667	SPERT	Q8NA61	448 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RBM23-233	ENST00000557667	HAS2	Q92819	552 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RBM23-233	ENST00000557667	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RBM23-233	ENST00000557667	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RBM23-233	ENST00000557667	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RBM23-233	ENST00000557667	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RBM23-233	ENST00000557667	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
RBM23-233	ENST00000557667	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667		A0A1B0GVG6	124 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	C4orf47	A7E2U8	309 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667		H3BML4	177 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	HCK	P08631	526 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	DTYMK	P23919	212 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	SLC10A1	Q14973	349 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	PMEPA1	Q969W9	287 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	CHST5	Q9GZS9	411 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	BCO1	Q9HAY6	547 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	DIRAS3	O95661	229 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	RAB3D	O95716	219 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	GTF2F2	P13984	249 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	FUT4	P22083	530 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	CDK2	P24941	298 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	DCAF10	Q5QP82	559 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	AWAT2	Q6E213	333 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	PIP4P1	Q86T03	277 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	NOX3	Q9HBY0	568 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	NLK	Q9UBE8	527 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	GLS2	Q9UI32	602 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	FAM186A	A6NE01	2351 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	HMSD	A8MTL9	139 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	LY86	O95711	162 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	MAS1	P04201	325 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	HOXC12	P31275	282 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	CD79B	P40259	229 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	MDGA2	Q7Z553	956 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	TM2D1	Q9BX74	207 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	NPTN	Q9Y639	398 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667		A0A0D9SG52	128 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	CIB4	A0PJX0	185 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	OR14I1	A6ND48	311 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667		M0R135	149 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	TNFRSF10A	O00220	468 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	ADAM10	O14672	748 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	TIAF1	O95411	115 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	WNT11	O96014	354 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	ACSM4	P0C7M7	580 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	SOX2	P48431	317 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	RSU1	Q15404	277 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	COQ8A	Q8NI60	647 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	APH1A	Q96BI3	265 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF799	Q96GE5	643 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	EML5	Q05BV3	1969 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	LDLRAD4	O15165	306 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	ZIC3	O60481	467 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	SP1	P08047	785 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	TGFBR1	P36897	503 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	GZMK	P49863	264 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	DHODH	Q02127	395 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	IKZF1	Q13422	519 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	OR1C1	Q15619	314 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-233	ENST00000557667	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21

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