RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 GLCEO94923 617 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 IGHV3-13P01766 116 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 HPXP02790 462 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 DAOP14920 347 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 EGR1P18146 543 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 COL8A2P25067 703 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 MAGEB1P43366 347 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 ENTPD1P49961 510 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 PDLIM4P50479 330 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 DSCR9P59020 149 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 ESRRGP62508 458 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 PSG7Q13046 419 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 TSTQ16762 297 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 KDM4DQ6B0I6 523 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 DPY19L4Q7Z388 723 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 DCXRQ7Z4W1 244 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 BBS1Q8NFJ9 593 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 OR10S1Q8NGN2 331 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 OR6N2Q8NGY6 317 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 C10orf105Q8TEF2 133 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 UBASH3BQ8TF42 649 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 DNAJC9Q8WXX5 260 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 CMBLQ96DG6 245 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 C1orf159Q96HA4 380 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 COQ7Q99807 217 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 CIB1Q99828 191 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 ATF6BQ99941 703 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 TEX12Q9BXU0 123 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 HDHD2Q9H0R4 259 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 SLC25A19Q9HC21 320 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 PTTG3PQ9NZH4 202 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 GPR160Q9UJ42 338 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 KCNG2Q9UJ96 466 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 C17orf100A8MU93 164 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 ANKRD65E5RJM6 399 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 M0R129 80 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 SPRY3O43610 288 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 PRKYO43930 277 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 SELENOFO60613 162 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 LCATP04180 440 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 ACSM4P0C7M7 580 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 IGHV4-31P0DP07 118 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 PRKXP51817 358 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 BLVRAP53004 296 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 HCCSP53701 268 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 RPS7P62081 194 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 CCL8P80075 99 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 ECH1Q13011 328 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 APOFQ13790 326 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 TAF13Q15543 124 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 MOGQ16653 247 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 TEX30Q5JUR7 227 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 FAM120AOSQ5T036 256 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 CYB5R2Q6BCY4 276 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 ZFP1Q6P2D0 407 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 C10orf67Q8IYJ2 551 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 C1orf174Q8IYL3 243 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 PARP8Q8N3A8 854 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 SNX33Q8WV41 574 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 SLAMF6Q96DU3 332 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 CCDC140Q96MF4 163 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 IL4I1Q96RQ9 567 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 INTS14Q96SY0 518 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 OSBPL10Q9BXB5 764 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 RIBC2Q9H4K1 309 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 MSL2Q9HCI7 577 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 S100A14Q9HCY8 104 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 PLSCR5A0PG75 271 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 C5orf63A6NC05 138 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 ZAR1LA6NP61 321 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 TCF21O43680 179 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 CDC14BO60729 498 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 NCR1O76036 304 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 BAG2O95816 211 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 MT-ND5P03915 603 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 CSF3P09919 207 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 NAT1P18440 290 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-217ENST00000550044 HNF1AP20823 631 aa8.18□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms