RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 ARMC1Q9NVT9 282 aa4.77□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 HIF1ANQ9NWT6 349 aa4.77□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM53CQ9NYF3 392 aa4.77□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 PTTG3PQ9NZH4 202 aa4.77□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 MIOXQ9UGB7 285 aa4.77□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 METRNQ9UJH8 293 aa4.77□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 LAMP5Q9UJQ1 280 aa4.77□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP4.77□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF281Q9Y2X9 895 aa4.77□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 NPTNQ9Y639 398 aa4.77□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 LHFPL6Q9Y693 200 aa4.77□□□□□ -1.65
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CLSTN3-215ENST00000544584 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 LRP5LA4QPB2 252 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 PPIAL4DF5H284 164 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 TBX1O43435 398 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 TCF21O43680 179 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF254O75437 659 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 MPZL1O95297 269 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 SOX14O95416 240 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 PNPP00491 289 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 SBK2P0C263 348 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 ACSM4P0C7M7 580 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 PPIAL4FP0DN26 164 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 ATP6V1B1P15313 513 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 GATA4P43694 442 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 NPY4RP50391 375 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 CRISP1P54107 249 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 IL5RAQ01344 420 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 MVKQ03426 396 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 CRMP1Q14194 572 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 ATP6AP1Q15904 470 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 MEP1BQ16820 701 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 PCK2Q16822 640 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 CR1LQ2VPA4 569 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 DCAF12L2Q5VW00 463 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 CD276Q5ZPR3 534 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 OR2T2Q6IF00 324 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 CORO6Q6QEF8 472 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 KRT77Q7Z794 578 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 LINC00346Q8IVM7 164 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 OR6N2Q8NGY6 317 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 CLDND2Q8NHS1 167 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 NANPQ8TBE9 248 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 THEM6Q8WUY1 208 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 RFKQ969G6 155 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 SLCO4A1Q96BD0 722 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 SLAMF6Q96DU3 332 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 C1orf159Q96HA4 380 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 OR2V2Q96R30 315 aa4.76□□□□□ -1.65
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CLSTN3-215ENST00000544584 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC30A2Q9BRI3 323 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 MRI1Q9BV20 369 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 YIPF3Q9GZM5 350 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 NARFLQ9H6Q4 476 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 WDR76Q9H967 626 aa4.76□□□□□ -1.65
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CLSTN3-215ENST00000544584 TVP23BQ9NYZ1 205 aa4.76□□□□□ -1.65
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CLSTN3-215ENST00000544584 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 OR5V1Q9UGF6 321 aa4.76□□□□□ -1.65
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CLSTN3-215ENST00000544584 WIPI2Q9Y4P8 454 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa4.76□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa4.76□□□□□ -1.65
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CLSTN3-215ENST00000544584 A0A096LNT2 108 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 TVP23AA6NH52 213 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 CD300LBA8K4G0 201 aa4.75□□□□□ -1.65
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CLSTN3-215ENST00000544584 IGHV2-5P01817 119 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 SCG5P05408 212 aa4.75□□□□□ -1.65
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CLSTN3-215ENST00000544584 LYNX1P0DP58 116 aa4.75□□□□□ -1.65
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CLSTN3-215ENST00000544584 CD200P41217 278 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 CX3CR1P49238 355 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 PRKXP51817 358 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 BPIFB3P59826 476 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 CDK5Q00535 292 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 TMED1Q13445 227 aa4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CLSTN3-215ENST00000544584 MICBQ29980 383 aa4.75□□□□□ -1.65
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