RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 SNAI3Q3KNW1 292 aa7.57□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa7.57□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 ARMCX4Q5H9R4 360 aa7.57□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 DRAM2Q6UX65 266 aa7.57□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 C12orf54Q6X4T0 127 aa7.57□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 SPATC1Q76KD6 591 aa7.57□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 C1QL2Q7Z5L3 287 aa7.57□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 OR10S1Q8NGN2 331 aa7.57□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 OR11L1Q8NGX0 322 aa7.57□□□□□ -1.2
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LMO3-222ENST00000540445 OR2AE1Q8NHA4 323 aa7.57□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 SLAMF6Q96DU3 332 aa7.57□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 PLEKHA8Q96JA3 519 aa7.57□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 FEVQ99581 238 aa7.57□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 KCNJ15Q99712 375 aa7.57□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa7.57□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 MRI1Q9BV20 369 aa7.57□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
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LMO3-222ENST00000540445 SLC22A4Q9H015 551 aa7.57□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 C1orf21Q9H246 121 aa7.57□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 ZNF556Q9HAH1 456 aa7.57□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 TMEM165Q9HC07 324 aa7.57□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 VNN3Q9NY84 501 aa7.57□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 MIOXQ9UGB7 285 aa7.57□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 OR5V1Q9UGF6 321 aa7.57□□□□□ -1.2
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LMO3-222ENST00000540445 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa7.57□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa7.56□□□□□ -1.2
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LMO3-222ENST00000540445 CD300LBA8K4G0 201 aa7.56□□□□□ -1.2
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LMO3-222ENST00000540445 TBX1O43435 398 aa7.56□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 GMDSO60547 372 aa7.56□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 E2F6O75461 281 aa7.56□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 SLC2A1P11166 492 aa7.56□□□□□ -1.2
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LMO3-222ENST00000540445 MAB21L1Q13394 359 aa7.56□□□□□ -1.2
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LMO3-222ENST00000540445 GLYATL3Q5SZD4 288 aa7.56□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa7.56□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.56□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa7.56□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 SPATA24Q86W54 205 aa7.56□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
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LMO3-222ENST00000540445 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
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LMO3-222ENST00000540445 BCAS4Q8TDM0 211 aa7.56□□□□□ -1.2
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LMO3-222ENST00000540445 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 OR51V1Q9H2C8 321 aa7.56□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 MED20Q9H944 212 aa7.56□□□□□ -1.2
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LMO3-222ENST00000540445 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 OPN4Q9UHM6 478 aa7.56□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 LRCH1Q9Y2L9 728 aa7.56□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 INSIG2Q9Y5U4 225 aa7.56□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 DHRS12A0PJE2 317 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 AQP12BA6NM10 295 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 ZNF878C9JN71 531 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 ACOT8O14734 319 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 FSHBP01225 129 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 GRPP07492 148 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 PSKH1P11801 424 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 CPT2P23786 658 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 HILS1P60008 231 aa7.55□□□□□ -1.2
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LMO3-222ENST00000540445 GK3PQ14409 553 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 GINS1Q14691 196 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 MPPED2Q15777 294 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 TIGD6Q17RP2 521 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 ZNF181Q2M3W8 571 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 TEX30Q5JUR7 227 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 BTNL3Q6UXE8 466 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 USP43Q70EL4 1123 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 DPY19L4Q7Z388 723 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 KLBQ86Z14 1044 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 AQP12AQ8IXF9 295 aa7.55□□□□□ -1.2
LMO3-222ENST00000540445 IQCF1Q8N6M8 205 aa7.55□□□□□ -1.2
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