RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 GALMQ96C23 342 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 CMBLQ96DG6 245 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 ALG14Q96F25 216 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 SPACA5Q96QH8 159 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 TREM2Q9NZC2 230 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 RNF150Q9ULK6 438 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 QSER1Q2KHR3 1735 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 PTTG1O95997 202 aa8.52□□□□□ -1.05
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PTPRB-204ENST00000538708 RAP2BP61225 183 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 OR13G1Q8NGZ3 307 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 OR6S1Q8NH40 331 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 EXTL1Q92935 676 aa8.52□□□□□ -1.05
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PTPRB-204ENST00000538708 A0A1B0GTH9 108 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 A0A1W2PRD5 423 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 A0A1W2PRF3 423 aa8.51□□□□□ -1.05
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PTPRB-204ENST00000538708 T-ENOLP0DO92 83 aa8.51□□□□□ -1.05
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PTPRB-204ENST00000538708 SSTP61278 116 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 BLOC1S1P78537 153 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 STEAP1BQ6NZ63 245 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 DLEU7Q6UYE1 221 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 OSR2Q8N2R0 312 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 OR2M7Q8NG81 312 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 OR6K3Q8NGY3 331 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 HYLS1Q96M11 299 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 POFUT1Q9H488 388 aa8.51□□□□□ -1.05
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PTPRB-204ENST00000538708 ST8SIA5O15466 376 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 APEX1P27695 318 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
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PTPRB-204ENST00000538708 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 PRRX1P54821 245 aa8.51□□□□□ -1.05
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PTPRB-204ENST00000538708 SLC38A9Q8NBW4 561 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 LRRC29Q8WV35 223 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 AKR1E2Q96JD6 320 aa8.51□□□□□ -1.05
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PTPRB-204ENST00000538708 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.51□□□□□ -1.05
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PTPRB-204ENST00000538708 OR3A4PP47883 348 aa8.51□□□□□ -1.05
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PTPRB-204ENST00000538708 BCL2L10Q9HD36 194 aa8.51□□□□□ -1.05
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PTPRB-204ENST00000538708 CXXC4Q9H2H0 198 aa8.51□□□□□ -1.05
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PTPRB-204ENST00000538708 TLE4Q04727 773 aa8.51□□□□□ -1.05
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PTPRB-204ENST00000538708 THNSL2Q86YJ6 484 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 CYSLTR2Q9NS75 346 aa8.51□□□□□ -1.05
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PTPRB-204ENST00000538708 PPT1P50897 306 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 DLX5P56178 289 aa8.5□□□□□ -1.05
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PTPRB-204ENST00000538708 OR51A4Q8NGJ6 313 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 ST8SIA2Q92186 375 aa8.5□□□□□ -1.05
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PTPRB-204ENST00000538708 C4orf45Q96LM5 186 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 ST3GAL6Q9Y274 331 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 LY75O60449 1722 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 B4E171 279 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 GP1BAP07359 652 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 SP1P08047 785 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRB-204ENST00000538708 OR5G3P0C626 314 aa8.5□□□□□ -1.05
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