RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531867.1

PUM1-222, Transcript of pumilio RNA binding family member 1, human

TSL 4

Gene PUM1, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM1-222	ENST00000531867	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	C1RL	Q9NZP8	487 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	CD274	Q9NZQ7	290 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	OPN4	Q9UHM6	478 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	CIB4	A0PJX0	185 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF195	O14628	629 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ARPC3	O15145	178 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	KRT36	O76013	467 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	DFFB	O76075	338 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	CLDN9	O95484	217 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	IGKV1D-16	P01601	117 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ALPL	P05186	524 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	FGF2	P09038	288 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	LYNX1	P0DP58	116 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	SFTPD	P35247	375 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	MAP3K8	P41279	467 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	TMEM33	P57088	247 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	KRTAP10-3	P60369	221 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ATP6V0D1	P61421	351 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ZP4	Q12836	540 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	SAXO2	Q658L1	398 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	STEAP4	Q687X5	459 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	LEG1	Q6P5S2	330 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	CARM1	Q86X55	608 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	TMEM99	Q8N816	258 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	TEX45	Q8NA69	505 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	NUP37	Q8NFH4	326 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	TMEM163	Q8TC26	289 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ZFP90	Q8TF47	636 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	MITD1	Q8WV92	249 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	TMEM45B	Q96B21	275 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	HAVCR1	Q96D42	359 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	COQ2	Q96H96	371 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	RNF121	Q9H920	327 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	TREM2	Q9NZC2	230 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	AHSP	Q9NZD4	102 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	OPTC	Q9UBM4	332 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	PLXNB1	O43157	2135 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867		A0A0G2JMP0	313 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867		A0A0X1KG70	313 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867		C9JVG2	144 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	KLF11	O14901	512 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	RNF13	O43567	381 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	B4GALT1	P15291	398 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	COL8A2	P25067	703 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	STX2	P32856	288 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	MNDA	P41218	407 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	CLDN8	P56748	225 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	PRPS1	P60891	318 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	FOXF1	Q12946	379 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	PTGR1	Q14914	329 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUM1-222	ENST00000531867		Q3ZCU0	254 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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