RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530747.5

ARHGEF12-210, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF12, Length 1,930 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12-210ENST00000530747 DCDP81605 110 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
ARHGEF12-210ENST00000530747 BCL2L1Q07817 233 aa5.09□□□□□ -1.59
ARHGEF12-210ENST00000530747 FAM74A1Q5RGS3 127 aa5.09□□□□□ -1.59
ARHGEF12-210ENST00000530747 FAM162BQ5T6X4 162 aa5.09□□□□□ -1.59
ARHGEF12-210ENST00000530747 CST9Q5W186 159 aa5.09□□□□□ -1.59
ARHGEF12-210ENST00000530747 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
ARHGEF12-210ENST00000530747 TCTE3Q8IZS6 198 aa5.09□□□□□ -1.59
ARHGEF12-210ENST00000530747 MUC15Q8N387 334 aa5.09□□□□□ -1.59
ARHGEF12-210ENST00000530747 GCSAMQ8N6F7 178 aa5.09□□□□□ -1.59
ARHGEF12-210ENST00000530747 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
ARHGEF12-210ENST00000530747 BMPERQ8N8U9 685 aa5.09□□□□□ -1.59
ARHGEF12-210ENST00000530747 CHST4Q8NCG5 386 aa5.09□□□□□ -1.59
ARHGEF12-210ENST00000530747 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa5.09□□□□□ -1.59
ARHGEF12-210ENST00000530747 ATG4AQ8WYN0 398 aa5.09□□□□□ -1.59
ARHGEF12-210ENST00000530747 NUS1Q96E22 293 aa5.09□□□□□ -1.59
ARHGEF12-210ENST00000530747 GRAMD2BQ96HH9 432 aa5.09□□□□□ -1.59
ARHGEF12-210ENST00000530747 OR52B2Q96RD2 323 aa5.09□□□□□ -1.59
ARHGEF12-210ENST00000530747 ATP5SQ99766 215 aa5.09□□□□□ -1.59
ARHGEF12-210ENST00000530747 MEGF9Q9H1U4 602 aa5.09□□□□□ -1.59
ARHGEF12-210ENST00000530747 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
ARHGEF12-210ENST00000530747 ACP6Q9NPH0 428 aa5.09□□□□□ -1.59
ARHGEF12-210ENST00000530747 PRO0628Q9UI54 55 aa5.09□□□□□ -1.59
ARHGEF12-210ENST00000530747 TNFSF18Q9UNG2 199 aa5.09□□□□□ -1.59
ARHGEF12-210ENST00000530747 DHDHQ9UQ10 334 aa5.09□□□□□ -1.59
ARHGEF12-210ENST00000530747 U3KQ87 197 aa5.09□□□□□ -1.59
ARHGEF12-210ENST00000530747 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 A0A0G2JNG1 304 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 F8VVB4 439 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 F8VWA3 439 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 NPIPB9F8W1W9 429 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 H3BS24 57 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 ENSAO43768 121 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 RDH16O75452 317 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 MT-CO3P00414 261 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 IFNA7P01567 189 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 UMODP07911 640 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 TACSTD2P09758 323 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 AZU1P20160 251 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 SLC2A5P22732 501 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 NTSP30990 170 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 GZMKP49863 264 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 CLDN6P56747 220 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 IFITM3Q01628 133 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 CAV1Q03135 178 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 GNMTQ14749 295 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 KIR2DS5Q14953 304 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 UNC50Q53HI1 259 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 C6orf52Q5T4I8 152 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 KDM4DQ6B0I6 523 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 ANKRD54Q6NXT1 300 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 LYPD4Q6UWN0 246 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 DHRS11Q6UWP2 260 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 PAMR1Q6UXH9 720 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 NAPRTQ6XQN6 538 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 CBLL1Q75N03 491 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 NAA40Q86UY6 237 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 ZNF567Q8N184 647 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 SLC16A11Q8NCK7 471 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 GJC3Q8NFK1 279 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 BEST4Q8NFU0 473 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 OR4C13Q8NGP0 309 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 OR14A16Q8NHC5 309 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 C20orf173Q96LM9 149 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 OR6C1Q96RD1 312 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 LINC00470Q9BZP3 86 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 OR51J1Q9H342 316 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 MUTYHQ9UIF7 546 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 A0A1W2PPI3 338 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 TAPBPO15533 448 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 ZIC3O60481 467 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 TRAPPC6AO75865 159 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 CDS2O95674 445 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 NUDT3O95989 172 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 UBBP0CG47 229 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 CD33P20138 364 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 FGF7P21781 194 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 LEPP41159 167 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 TNFSF9P41273 254 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 AVPR1BP47901 424 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 PAFAH1B2P68402 229 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF12-210ENST00000530747 RUNX1Q01196 453 aa5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms