RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515564.5

GATB-212, Transcript of glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B, humanhuman

TSL 2

Gene GATB, Length 6,552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATB-212ENST00000515564 C3orf80F5H4A9 247 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 ETV6P41212 452 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 RAB5BP61020 215 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 PPP1CAP62136 330 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 AQP6Q13520 282 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 CMPK2Q5EBM0 449 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 ZNF546Q86UE3 836 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 COMMD7Q86VX2 200 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 SFTPA2Q8IWL1 248 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 IKZF5Q9H5V7 419 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 CHODLQ9H9P2 273 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 OSGIN1Q9UJX0 560 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 ARNTP27540 789 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 GDNFP39905 211 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 MTNR1BP49286 362 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 PPP1CBP62140 327 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 XKR7Q5GH72 579 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 DBX2Q6ZNG2 339 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 C20orf24Q9BUV8 137 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 R4GMQ9 66 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 EVPLQ92817 2033 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 A0A087WUJ7 227 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 ADAM20O43506 726 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 CHRM2P08172 466 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 CCL2P13500 99 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 PCMT1P22061 227 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 RPS27P42677 84 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 PCK2Q16822 640 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 C15orf54Q8N8G6 183 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 ANKRD53Q8N9V6 530 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 PLPP5Q8NEB5 264 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 OR6K3Q8NGY3 331 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 GLRX2Q9NS18 164 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 A4GNTQ9UNA3 340 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 TRABD2BA6NFA1 517 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 FAM157AC9JC47 383 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 HAX1O00165 279 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 SRD5A2P31213 254 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 GALNSP34059 522 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 FUT6P51993 359 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 PRDX4Q13162 271 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 CLEC2AQ6UVW9 174 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 SLC38A9Q8NBW4 561 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 LRRC29Q8WV35 223 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 SIAEQ9HAT2 523 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 ASIC5Q9NY37 505 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 A0A0B4J203 849 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 CEACAM3P40198 252 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 ISXQ2M1V0 245 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 ACSM5Q6NUN0 579 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 THSD4Q6ZMP0 1018 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 CMBLQ96DG6 245 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 OR2B2Q9GZK3 357 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 ST3GAL6Q9Y274 331 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 ECM29Q5VYK3 1845 aa7.5□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa7.49□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 APEX1P27695 318 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 BPIFB3P59826 476 aa7.49□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 RHBDD2Q6NTF9 364 aa7.49□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 NPEPL1Q8NDH3 523 aa7.49□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 TEX37Q96LM6 180 aa7.49□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 FITM1A5D6W6 292 aa7.49□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa7.49□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 SMIM17P0DL12 118 aa7.49□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 TAF9Q16594 264 aa7.49□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 SPANXN5Q5MJ07 72 aa7.49□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 CYHR1Q6ZMK1 362 aa7.49□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 CARFQ8N187 725 aa7.49□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 OSR2Q8N2R0 312 aa7.49□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 DEDD2Q8WXF8 326 aa7.49□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 EXTL1Q92935 676 aa7.49□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 MISP3Q96FF7 219 aa7.49□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 UPK1BO75841 260 aa7.49□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 RPL34P49207 117 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 DLX5P56178 289 aa7.49□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 ZNF117Q03924 483 aa7.49□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 EGR3Q06889 387 aa7.49□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 C20orf27Q9GZN8 174 aa7.49□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 SPNS1Q9H2V7 528 aa7.49□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 CLEC5AQ9NY25 188 aa7.49□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa7.49□□□□□ -1.21
GATB-212ENST00000515564 DEFB108AA8MXU0 73 aa7.49□□□□□ -1.21
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