RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
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SH3BP2-220ENST00000511663 TECTBQ96PL2 329 aa16.07■□□□□ 0.16
SH3BP2-220ENST00000511663 MYLK2Q9H1R3 596 aa16.07■□□□□ 0.16
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SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF446Q9NWS9 450 aa16.07■□□□□ 0.16
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SH3BP2-220ENST00000511663 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
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SH3BP2-220ENST00000511663 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF879B4DU55 563 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-220ENST00000511663 C3orf80F5H4A9 247 aa16.02■□□□□ 0.16
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SH3BP2-220ENST00000511663 KNG1P01042 644 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-220ENST00000511663 SPARCP09486 303 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-220ENST00000511663 MDKP21741 143 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-220ENST00000511663 MXRA7P84157 204 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-220ENST00000511663 SNAI3Q3KNW1 292 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-220ENST00000511663 METTL11BQ5VVY1 283 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-220ENST00000511663 C17orf107Q6ZR85 190 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-220ENST00000511663 DCXRQ7Z4W1 244 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP2-220ENST00000511663 LNX2Q8N448 690 aa16.02■□□□□ 0.16
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SH3BP2-220ENST00000511663 OR2AE1Q8NHA4 323 aa16.02■□□□□ 0.16
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