RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511362.5

ATXN3-211, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 3

Gene ATXN3, Length 591 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-211ENST00000511362 OBSL1O75147 1896 aa2.6□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 VPS13CQ709C8 3753 aa2.6□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 CHD5Q8TDI0 1954 aa2.6□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 A0A1B0GTI1 187 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 PRSS37A4D1T9 235 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 TMEM150BA6NC51 233 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 NEMP2A6NFY4 417 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 CCDC160A6NGH7 325 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 MPTX1A8MV57 137 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 OR11H12B2RN74 326 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 PPIAL4DF5H284 164 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 G3V3Y1 287 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 H3BNH8 94 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 IFNL4K9M1U5 179 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 M0R036 132 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 KCNK1O00180 336 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 PDXKO00764 312 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 SDHDO14521 159 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 TP53I11O14683 189 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 CTDSPLO15194 276 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 SIGLEC5O15389 551 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 XRCC2O43543 280 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 SYNGR3O43761 229 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 RP2O75695 350 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 OR2J2O76002 312 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 TM7SF2O76062 418 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 SUPT7LO94864 414 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 GLSO94925 669 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 OR6A2O95222 327 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 MOCS3O95396 460 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 AP2A1O95782 977 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 TSPAN12O95859 305 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 IGF2P01344 180 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 APOHP02749 345 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 C2P06681 752 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 OR4Q2P0C623 313 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 ETFAP13804 333 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 MMP9P14780 707 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 B4GALT1P15291 398 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 IMPDH1P20839 514 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 SERPINA2P20848 420 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 STOMP27105 288 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 PSMB4P28070 264 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 SSTR5P35346 364 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 PMELP40967 661 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 CD200P41217 278 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 TNFRSF4P43489 277 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 MAP2K4P45985 399 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 QARSP47897 775 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 PSMD8P48556 350 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 CSNK1A1P48729 337 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 XKP51811 444 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 EFNA3P52797 238 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 OR4D2P58180 307 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 RPS20P60866 119 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 RPL19P84098 196 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 EMX2Q04743 252 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 FGL1Q08830 312 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 ZP4Q12836 540 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 TAF13Q15543 124 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 TRIP10Q15642 601 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 TATDN3Q17R31 274 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 ISXQ2M1V0 245 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 SMIM21Q3B7S5 101 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 POM121L1PQ3SYA9 428 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 CDNFQ49AH0 187 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 VPS26BQ4G0F5 336 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 PTPN20Q4JDL3 420 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 C14orf177Q52M58 125 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 GCSAMLQ5JQS6 135 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 UBE2UQ5VVX9 321 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 SAXO2Q658L1 398 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 LEMD1Q68G75 181 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 TMEM42Q69YG0 159 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 NANOGP8Q6NSW7 305 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF774Q6NX45 483 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 NIPAL3Q6P499 406 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 ATRAIDQ6UW56 229 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 SCIMPQ6UWF3 145 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF836Q6ZNA1 936 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 SLC16A13Q7RTY0 426 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 DPY19L4Q7Z388 723 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 TMEM25Q86YD3 366 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 RIMKLAQ8IXN7 391 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 C4orf19Q8IY42 314 aa2.59□□□□□ -1.99
ATXN3-211ENST00000511362 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa2.59□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms