RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC25A53Q5H9E4 307 aa6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 NCMAPQ5T1S8 102 aa6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 FBXW9Q5XUX1 488 aa6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC22A10Q63ZE4 541 aa6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 WDR88Q6ZMY6 472 aa6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 GRINAQ7Z429 371 aa6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM200AQ86VY9 491 aa6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 NRMQ8IXM6 262 aa6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 FADS6Q8N9I5 356 aa6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CLEC1AQ8NC01 280 aa6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF563Q8TA94 476 aa6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 GPR119Q8TDV5 335 aa6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 DUSP19Q8WTR2 217 aa6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ASB13Q8WXK3 278 aa6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ATF6BQ99941 703 aa6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 CACNG6Q9BXT2 260 aa6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF226Q9NYT6 803 aa6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa6.46□□□□□ -1.37
SMARCE1-211ENST00000493660 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 EML6Q6ZMW3 1958 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A087WZY1 265 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 OR14I1A6ND48 311 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 RAB5AP20339 215 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 FGF7P21781 194 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 NFYBP25208 207 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ITPKBP27987 946 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 EPHA2P29317 976 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 CASRP41180 1078 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 RAP1BP61224 184 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 PPIAP62937 165 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 PLA2G7Q13093 441 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SPHARQ15513 63 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 HAGHQ16775 308 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ELOA3BQ3SY89 546 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ABHD17BQ5VST6 288 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 IL20RBQ6UXL0 311 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 GCNT2Q8N0V5 402 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ELOA3Q8NG57 546 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2M3Q8NG83 312 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 OR5M3Q8NGP4 307 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ARL11Q969Q4 196 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 OR14A2Q96R54 314 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 CHIAQ9BZP6 476 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 TLNRD1Q9H1K6 362 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 FKRPQ9H9S5 495 aa6.46□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 DCDC2BA2VCK2 349 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 UNC119BA6NIH7 251 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SMPD2O60906 423 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ZFPL1O95159 310 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ITGA5P08648 1049 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 MAGEB1P43366 347 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 C1DQ13901 141 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 TGIF1Q15583 401 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 KRTCAP3Q53RY4 240 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 C12orf73Q69YU5 71 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 RAB12Q6IQ22 244 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF620Q6ZNG0 422 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ASB18Q6ZVZ8 466 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 OAFQ86UD1 273 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SIRT6Q8N6T7 355 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 LIPHQ8WWY8 451 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 HSD17B8Q92506 261 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 PNPLA2Q96AD5 504 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 BPIFA2Q96DR5 249 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 RSRP1Q9BUV0 290 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 DPH1Q9BZG8 443 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 AMBNQ9NP70 447 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 TAS2R16Q9NYV7 291 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 FBXO7Q9Y3I1 522 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 PCNX3Q9H6A9 2034 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 CUL9Q8IWT3 2517 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 IFITM10A6NMD0 228 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM238C9JI98 176 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 RCBTB2O95199 551 aa6.45□□□□□ -1.38
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