RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	IL17B	Q9UHF5	180 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	HHLA2	Q9UM44	414 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A0A6YYH2	397 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A0G2JMP0	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A0X1KG70	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1B0GTH9	108 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	PINLYP	A6NC86	204 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247		A6NJ64	397 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	MASP2	O00187	686 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC17A2	O00624	439 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	LDLRAD4	O15165	306 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	DHH	O43323	396 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	NME2P1	O60361	137 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	CYTIP	O60759	359 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	PEX14	O75381	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	TOX4	O94842	621 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	PAH	P00439	452 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	CD2	P06729	351 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	QDPR	P09417	244 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	KLK2	P20151	261 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	MSR1	P21757	451 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC6A1	P30531	599 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	RANBP1	P43487	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	KIR2DL3	P43628	341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	CSNK1A1	P48729	337 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	RAG2	P55895	527 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	PER3	P56645	1201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	CLDN17	P56750	224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	CLDN20	P56880	219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	CAMK2D	Q13557	499 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	DYRK1A	Q13627	763 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	IL18	Q14116	193 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	OR1C1	Q15619	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM27B	Q5VT28	67 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	AGAP6	Q5VW22	663 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	TRIQK	Q629K1	86 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF627	Q7L945	461 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	PRSS33	Q8NF86	280 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	YIPF5	Q969M3	257 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	ITFG2	Q969R8	447 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC25A28	Q96A46	364 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	RFT1	Q96AA3	541 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	SCMH1	Q96GD3	660 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	SFXN2	Q96NB2	322 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	AGAP4	Q96P64	663 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	ABHD1	Q96SE0	405 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	EMC6	Q9BV81	110 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	NELFA	Q9H3P2	528 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	STMN3	Q9NZ72	180 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	DHDH	Q9UQ10	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A0U1RQV5	110 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1B0GTI1	187 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1W2PPK0	400 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	OR5H15	A6NDH6	313 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG4A-208	ENST00000489247	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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