RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		9.39	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		9.39	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		9.39	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	DRAM2	Q6UX65	266 aa		9.39	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		9.39	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	9.39	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		9.39	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		9.39	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		9.39	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	9.39	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM163	Q8TC26	289 aa		9.39	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCL17	Q92583	94 aa		9.39	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	C1orf159	Q96HA4	380 aa		9.39	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		9.39	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		9.39	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		9.39	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		9.39	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		9.39	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	BRD7	Q9NPI1	651 aa		9.39	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		9.39	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		9.39	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		9.39	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	9.39	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	9.38	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	TGFA	P01135	160 aa		9.38	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	IGHV2-70	P01814	119 aa		9.38	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	9.38	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	HSD11B1	P28845	292 aa		9.38	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	LIPA	P38571	399 aa		9.38	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	9.38	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	TAF13	Q15543	124 aa		9.38	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	HFE	Q30201	348 aa		9.38	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		9.38	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		9.38	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		9.38	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM166A	Q6J272	317 aa		9.38	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM57B	Q71RH2	274 aa		9.38	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	PGAP1	Q75T13	922 aa		9.38	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	SHF	Q7M4L6	423 aa		9.38	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		9.38	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	9.38	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		9.38	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	DIRC2	Q96SL1	478 aa		9.38	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	9.38	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		9.38	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		9.38	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	LRP12	Q9Y561	859 aa		9.38	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	ISPD	A4D126	451 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	CD300LB	A8K4G0	201 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	9.37	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	LMX1B	O60663	402 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF205	O95201	554 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	APOL3	O95236	402 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	9.37	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	IGHV2-5	P01817	119 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	ALPL	P05186	524 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	ALOX5AP	P20292	161 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	CA6	P23280	308 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	PMEL	P40967	661 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM33	P57088	247 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	MALL	Q13021	153 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	MAB21L1	Q13394	359 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM201A	Q5SY85	155 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	SSX6	Q7RTT6	188 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	THEM6	Q8WUY1	208 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	HPS1	Q92902	700 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPSB4	Q96A44	273 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	LYZL4	Q96KX0	146 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	MBOAT4	Q96T53	435 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	TEAD3	Q99594	435 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	GCM1	Q9NP62	436 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	IL19	Q9UHD0	177 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959		E9PQ18	207 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	XRCC2	O43543	280 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	H2BFM	P0C1H6	154 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	RAD23A	P54725	363 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM3A	P98173	230 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZMYND11	Q15326	602 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	MPPED2	Q15777	294 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	CR1L	Q2VPA4	569 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	WDR86	Q86TI4	376 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	CBR4	Q8N4T8	237 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		9.36	□□□□□ -0.91

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