RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 RGCCQ9H4X1 137 aa16.07■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 TMEM100Q9NV29 134 aa16.07■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 ZNF391Q9UJN7 358 aa16.07■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 LAMP5Q9UJQ1 280 aa16.07■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 CCDC182A6NF36 153 aa16.06■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 ACOD1A6NK06 481 aa16.06■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 PPIHO43447 177 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 IGHV4-31P0DP07 118 aa16.06■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 DCTDP32321 178 aa16.06■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 CX3CR1P49238 355 aa16.06■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 SRP9P49458 86 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 POU4F2Q12837 409 aa16.06■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 SNAI3Q3KNW1 292 aa16.06■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 C6orf52Q5T4I8 152 aa16.06■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 KLBQ86Z14 1044 aa16.06■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 STMN2Q93045 179 aa16.06■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 RIBC2Q9H4K1 309 aa16.06■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 ZFHX3Q15911 3703 aa16.06■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 A8MV72 311 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 EI24O14681 340 aa16.05■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 CDC14BO60729 498 aa16.05■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 ZNF254O75437 659 aa16.05■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 PRSS45Q7RTY3 260 aa16.05■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 RFKQ969G6 155 aa16.05■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 ERGIC1Q969X5 290 aa16.05■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 HRASLS5Q96KN8 279 aa16.05■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 OR10A2Q9H208 303 aa16.05■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 CD300LBA8K4G0 201 aa16.04■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 ROM1Q03395 351 aa16.04■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 ZNF92Q03936 586 aa16.04■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 MZT1Q08AG7 82 aa16.04■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 ZNF181Q2M3W8 571 aa16.04■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 GLYATL3Q5SZD4 288 aa16.04■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 Q71RC1 249 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 OR5AS1Q8N127 324 aa16.04■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 SPERTQ8NA61 448 aa16.04■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 CCL17Q92583 94 aa16.04■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 OR2V2Q96R30 315 aa16.04■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 AMELYQ99218 206 aa16.04■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 MROQ9BYG7 248 aa16.04■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 C8orf4Q9NR00 106 aa16.04■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 GGT3PA6NGU5 568 aa16.03■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 GMDSO60547 372 aa16.03■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 HTR1FP30939 366 aa16.03■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 GATA4P43694 442 aa16.03■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 ZSCAN26Q16670 478 aa16.03■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 TIGD6Q17RP2 521 aa16.03■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 SLC25A30Q5SVS4 291 aa16.03■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 FAM166AQ6J272 317 aa16.03■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 SPATC1Q76KD6 591 aa16.03■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 KRT77Q7Z794 578 aa16.03■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 ZNF679Q8IYX0 411 aa16.03■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 FTMTQ8N4E7 242 aa16.03■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 CBR4Q8N4T8 237 aa16.03■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 PLPP7Q8NBV4 271 aa16.03■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 ITLN1Q8WWA0 313 aa16.03■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 RAB39BQ96DA2 213 aa16.03■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 IL4I1Q96RQ9 567 aa16.03■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 YAE1D1Q9NRH1 226 aa16.03■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 TMEM106BQ9NUM4 274 aa16.03■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 IMPAD1Q9NX62 359 aa16.03■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 LPAR3Q9UBY5 353 aa16.03■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa16.03■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP16.03■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 TANC2Q9HCD6 1990 aa16.02■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 SNTNA6NMZ2 147 aa16.02■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 B4DSR2 109 aa16.02■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 E9PQ18 207 aa16.02■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 FSTL3O95633 263 aa16.02■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 ANPEPP15144 967 aa16.02■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 PCMT1P22061 227 aa16.02■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 CPT2P23786 658 aa16.02■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 CD200P41217 278 aa16.02■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 TRIP10Q15642 601 aa16.02■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 MEDAGQ5VYS4 303 aa16.02■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa16.02■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 LINC01356Q8N9X3 169 aa16.02■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 BHLHE23Q8NDY6 225 aa16.02■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 OR2AE1Q8NHA4 323 aa16.02■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 CLDND2Q8NHS1 167 aa16.02■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 PGAM5Q96HS1 289 aa16.02■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 MEGF10Q96KG7 1140 aa16.02■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 RDH12Q96NR8 316 aa16.02■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 CLN6Q9NWW5 311 aa16.02■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 KCNS2Q9ULS6 477 aa16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58 ms