RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468018.5

ATG4B-215, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 721 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-215ENST00000468018 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
ATG4B-215ENST00000468018 MEGF10Q96KG7 1140 aa12.79□□□□□ -0.36
ATG4B-215ENST00000468018 ZNF665Q9H7R5 613 aa12.79□□□□□ -0.36
ATG4B-215ENST00000468018 CENPMQ9NSP4 180 aa12.79□□□□□ -0.36
ATG4B-215ENST00000468018 TVP23BQ9NYZ1 205 aa12.79□□□□□ -0.36
ATG4B-215ENST00000468018 KIF17Q9P2E2 1029 aa12.79□□□□□ -0.36
ATG4B-215ENST00000468018 NPTNQ9Y639 398 aa12.79□□□□□ -0.36
ATG4B-215ENST00000468018 CD300LBA8K4G0 201 aa12.78□□□□□ -0.36
ATG4B-215ENST00000468018 CIB2O75838 187 aa12.78□□□□□ -0.36
ATG4B-215ENST00000468018 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
ATG4B-215ENST00000468018 RBMXP38159 391 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
ATG4B-215ENST00000468018 SLC15A1P46059 708 aa12.78□□□□□ -0.36
ATG4B-215ENST00000468018 MMP16P51512 607 aa12.78□□□□□ -0.36
ATG4B-215ENST00000468018 PRKXP51817 358 aa12.78□□□□□ -0.36
ATG4B-215ENST00000468018 RAD23AP54725 363 aa12.78□□□□□ -0.36
ATG4B-215ENST00000468018 MALLQ13021 153 aa12.78□□□□□ -0.36
ATG4B-215ENST00000468018 MAB21L1Q13394 359 aa12.78□□□□□ -0.36
ATG4B-215ENST00000468018 SNAPC1Q16533 368 aa12.78□□□□□ -0.36
ATG4B-215ENST00000468018 CR1LQ2VPA4 569 aa12.78□□□□□ -0.36
ATG4B-215ENST00000468018 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa12.78□□□□□ -0.36
ATG4B-215ENST00000468018 ZNF454Q8N9F8 522 aa12.78□□□□□ -0.36
ATG4B-215ENST00000468018 BHLHE23Q8NDY6 225 aa12.78□□□□□ -0.36
ATG4B-215ENST00000468018 OR2AE1Q8NHA4 323 aa12.78□□□□□ -0.36
ATG4B-215ENST00000468018 TEX12Q9BXU0 123 aa12.78□□□□□ -0.36
ATG4B-215ENST00000468018 SHARPINQ9H0F6 387 aa12.78□□□□□ -0.36
ATG4B-215ENST00000468018 OPA3Q9H6K4 179 aa12.78□□□□□ -0.36
ATG4B-215ENST00000468018 KRT84Q9NSB2 600 aa12.78□□□□□ -0.36
ATG4B-215ENST00000468018 TMEM100Q9NV29 134 aa12.78□□□□□ -0.36
ATG4B-215ENST00000468018 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa12.78□□□□□ -0.36
ATG4B-215ENST00000468018 H3BNX3 289 aa12.77□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 TMEM178BH3BS89 294 aa12.77□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 IFNL4K9M1U5 179 aa12.77□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 XRCC2O43543 280 aa12.77□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 PRKYO43930 277 aa12.77□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 FSTL3O95633 263 aa12.77□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 MSMBP08118 114 aa12.77□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 SLC2A1P11166 492 aa12.77□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 ALOX5APP20292 161 aa12.77□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 THBS2P35442 1172 aa12.77□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 CD200P41217 278 aa12.77□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 CX3CR1P49238 355 aa12.77□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 TMEM155Q4W5P6 130 aa12.77□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 KLHL12Q53G59 568 aa12.77□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 CCDC121Q6ZUS5 278 aa12.77□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 TMEM186Q96B77 213 aa12.77□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 OTULINQ96BN8 352 aa12.77□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 RAB39BQ96DA2 213 aa12.77□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 PLEKHA8Q96JA3 519 aa12.77□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 TEAD3Q99594 435 aa12.77□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 CIB1Q99828 191 aa12.77□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 OSBPL10Q9BXB5 764 aa12.77□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 BEX2Q9BXY8 128 aa12.77□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 GABARAPL3Q9BY60 117 aa12.77□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 SLC22A4Q9H015 551 aa12.77□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 G6PC2Q9NQR9 355 aa12.77□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 ZNF319Q9P2F9 582 aa12.77□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa12.77□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 F5H5P2 479 aa12.76□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 HLA-DPB1P04440 258 aa12.76□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 LYNP07948 512 aa12.76□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 PMELP40967 661 aa12.76□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 SRP9P49458 86 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 BTG1P62324 171 aa12.76□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 APOFQ13790 326 aa12.76□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 TAF13Q15543 124 aa12.76□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 AADACL4Q5VUY2 407 aa12.76□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 NXNL2Q5VZ03 156 aa12.76□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 SPATC1Q76KD6 591 aa12.76□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 GLCCI1Q86VQ1 547 aa12.76□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 OR51F2Q8NH61 342 aa12.76□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 Q8TCH9 128 aa12.76□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 PYDC1Q8WXC3 89 aa12.76□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 SGK3Q96BR1 496 aa12.76□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa12.76□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 ENOPH1Q9UHY7 261 aa12.76□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 OAZ3Q9UMX2 235 aa12.76□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 ATRQ13535 2644 aa12.75□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 TRAV20A0A0B4J274 112 aa12.75□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa12.75□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 E9PQ18 207 aa12.75□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 F5H0A9 414 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 APOC1P02654 83 aa12.75□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 ANPEPP15144 967 aa12.75□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 HSD11B1P28845 292 aa12.75□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 FAM3AP98173 230 aa12.75□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 ZMYND11Q15326 602 aa12.75□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 SLC16A9Q7RTY1 509 aa12.75□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 OR56B2PQ8NGI1 322 aa12.75□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 OR52H1Q8NGJ2 320 aa12.75□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 TMEM163Q8TC26 289 aa12.75□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 ERGIC1Q969X5 290 aa12.75□□□□□ -0.37
ATG4B-215ENST00000468018 PRRG3Q9BZD7 231 aa12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms