RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454619.5

NME4-208, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, human

TSL 5

Gene NME4, Length 719 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NME4-208	ENST00000454619	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	MEP1B	Q16820	701 aa		11.77	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	CORO6	Q6QEF8	472 aa		11.77	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		11.77	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	REC114	Q7Z4M0	266 aa		11.77	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		11.77	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		11.77	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		11.77	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		11.77	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	ATF6B	Q99941	703 aa		11.77	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		11.77	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		11.77	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	MRGBP	Q9NV56	204 aa		11.77	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		11.77	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	AURKC	Q9UQB9	309 aa		11.77	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		11.77	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619		A0A0G2JND7	137 aa		11.76	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		11.76	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	DVL1	O14640	695 aa		11.76	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	PIN1P1	O15428	100 aa		11.76	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	OR10H3	O60404	316 aa		11.76	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	PTP4A3	O75365	173 aa		11.76	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	TXNDC12	O95881	172 aa		11.76	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	GYPA	P02724	150 aa		11.76	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	RPS6KA3	P51812	740 aa		11.76	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	EGR3	Q06889	387 aa		11.76	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	CDON	Q4KMG0	1287 aa		11.76	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		11.76	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		11.76	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		11.76	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	ST8SIA4	Q92187	359 aa		11.76	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	PITX2	Q99697	317 aa		11.76	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		11.76	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	GID8	Q9NWU2	228 aa		11.76	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		11.76	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		11.76	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		11.76	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		11.75	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	CD300LB	A8K4G0	201 aa		11.75	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	PPP1R3D	O95685	299 aa		11.75	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	ZNF682	O95780	498 aa		11.75	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	OPN1MW	P04001	364 aa		11.75	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		11.75	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		11.75	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	TPTE	P56180	551 aa		11.75	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	GUCA2A	Q02747	115 aa		11.75	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	MZT1	Q08AG7	82 aa		11.75	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	MAPRE2	Q15555	327 aa		11.75	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	SLC36A3	Q495N2	470 aa		11.75	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	IFI44L	Q53G44	452 aa		11.75	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		11.75	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		11.75	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619		Q6ZTK2	550 aa		11.75	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		11.75	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		11.75	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		11.75	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	SPERT	Q8NA61	448 aa		11.75	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		11.75	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	OR5R1	Q8NH85	324 aa		11.75	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		11.75	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	TSSK2	Q96PF2	358 aa		11.75	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		11.75	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		11.74	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		11.74	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	GGT3P	A6NGU5	568 aa		11.74	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619		A6NLC8	198 aa		11.74	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	DCTN6	O00399	190 aa		11.74	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	GGT2	P36268	569 aa		11.74	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	HERPUD1	Q15011	391 aa		11.74	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		11.74	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619		Q6ZPA2	131 aa		11.74	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		11.74	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		11.74	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		11.74	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		11.74	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		11.74	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		11.74	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		11.74	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		11.74	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	B9D1	Q9UPM9	204 aa		11.74	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		11.74	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619		M0R135	149 aa		11.73	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	FCN3	O75636	299 aa		11.73	□□□□□ -0.53
NME4-208	ENST00000454619	PAH	P00439	452 aa		11.73	□□□□□ -0.53

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