RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MALLQ13021 153 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OCLNQ16625 522 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZSCAN26Q16670 478 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SNAI3Q3KNW1 292 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LCN1P1Q5VSP4 162 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR2T2Q6IF00 324 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PGAP1Q75T13 922 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EGFL6Q8IUX8 553 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GID4Q8IVV7 300 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR52H1Q8NGJ2 320 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ASB17Q8WXJ9 295 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EME1Q96AY2 570 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ELMOD3Q96FG2 381 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IL4I1Q96RQ9 567 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 COPS4Q9BT78 406 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ADGRL4Q9HBW9 690 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MSL2Q9HCI7 577 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C8orf4Q9NR00 106 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CENPMQ9NSP4 180 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PTTG3PQ9NZH4 202 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF319Q9P2F9 582 aa9.51□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CD300LBA8K4G0 201 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PRR32B1ATL7 298 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 J3QRE1 110 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IFNL4K9M1U5 179 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MLNRO43193 412 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 XRCC2O43543 280 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGLV3-1P01715 115 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MMP16P51512 607 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CDC42P60953 191 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF181Q2M3W8 571 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPRNQ5BIV9 151 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GLYATL3Q5SZD4 288 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF684Q5T5D7 378 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 Q6ZSR3 168 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KLBQ86Z14 1044 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF679Q8IYX0 411 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF283Q8N7M2 679 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PLPP7Q8NBV4 271 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RHOXF1Q8NHV9 184 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 THEM6Q8WUY1 208 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OTULINQ96BN8 352 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR8B4Q96RC9 309 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MBOAT4Q96T53 435 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EGLN1Q9GZT9 426 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC22A4Q9H015 551 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RIBC2Q9H4K1 309 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RGCCQ9H4X1 137 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SAP30LQ9HAJ7 183 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DECR2Q9NUI1 292 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM100Q9NV29 134 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CLN6Q9NWW5 311 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM160Q9NX00 188 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF391Q9UJN7 358 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 JMJD1CQ15652 2540 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ABCA2Q9BZC7 2435 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 M0R129 80 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPRY3O43610 288 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 H2BFMP0C1H6 154 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TNFRSF1AP19438 455 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CFL1P23528 166 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CX3CR1P49238 355 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GZMKP49863 264 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CHN2P52757 468 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HCCSP53701 268 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RIPPLY3P57055 190 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LMO4P61968 165 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RPS7P62081 194 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM3AP98173 230 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC3A1Q07837 685 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 POU4F2Q12837 409 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TAF13Q15543 124 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR8B8Q15620 311 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TSTQ16762 297 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MEDAGQ5VYS4 303 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 USP51Q70EK9 711 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PACRGLQ8N7B6 248 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RFKQ969G6 155 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UBE2FQ969M7 185 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ERGIC1Q969X5 290 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SIGLEC11Q96RL6 698 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LAMP5Q9UJQ1 280 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 COPS3Q9UNS2 423 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ORC6Q9Y5N6 252 aa9.49□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 A0A0U1RQV5 110 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms