RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446903.5

TNS1-210, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TNS1, Length 2,464 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-210ENST00000446903 LRFN1Q9P244 771 aa12.21□□□□□ -0.45
TNS1-210ENST00000446903 ASH2LQ9UBL3 628 aa12.21□□□□□ -0.45
TNS1-210ENST00000446903 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
TNS1-210ENST00000446903 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
TNS1-210ENST00000446903 MED13Q9UHV7 2174 aa12.21□□□□□ -0.45
TNS1-210ENST00000446903 ZNF878C9JN71 531 aa12.21□□□□□ -0.45
TNS1-210ENST00000446903 NPIPA2E9PIF3 369 aa12.21□□□□□ -0.45
TNS1-210ENST00000446903 NPIPA3F8WFD2 350 aa12.21□□□□□ -0.45
TNS1-210ENST00000446903 SHOXO15266 292 aa12.21□□□□□ -0.45
TNS1-210ENST00000446903 CD2P06729 351 aa12.21□□□□□ -0.45
TNS1-210ENST00000446903 C2orf76Q3KRA6 126 aa12.21□□□□□ -0.45
TNS1-210ENST00000446903 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
TNS1-210ENST00000446903 RHOUQ7L0Q8 258 aa12.21□□□□□ -0.45
TNS1-210ENST00000446903 OR13C3Q8NGS6 347 aa12.21□□□□□ -0.45
TNS1-210ENST00000446903 SLC25A28Q96A46 364 aa12.21□□□□□ -0.45
TNS1-210ENST00000446903 FAM3DQ96BQ1 224 aa12.21□□□□□ -0.45
TNS1-210ENST00000446903 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa12.21□□□□□ -0.45
TNS1-210ENST00000446903 GINS4Q9BRT9 223 aa12.21□□□□□ -0.45
TNS1-210ENST00000446903 PBOV1Q9GZY1 135 aa12.21□□□□□ -0.45
TNS1-210ENST00000446903 POLR1DQ9Y2S0 133 aa12.21□□□□□ -0.45
TNS1-210ENST00000446903 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 CIB4A0PJX0 185 aa12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 UBE2QL1A1L167 161 aa12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 STMND1H3BQB6 276 aa12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 RER1O15258 196 aa12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 ANOS1P23352 680 aa12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 RAB14P61106 215 aa12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 GABREP78334 506 aa12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 CSRP2Q16527 193 aa12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 FAM209AQ5JX71 171 aa12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 BIVMQ86UB2 503 aa12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 LYPD6Q86Y78 171 aa12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 PLPP7Q8NBV4 271 aa12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 OR51A2Q8NGJ7 313 aa12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 NABP1Q96AH0 204 aa12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 TRAV18A0A075B6X5 111 aa12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 PLSCR5A0PG75 271 aa12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 WDPCPO95876 746 aa12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 CFDP00746 253 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 AKAIN1P0CW23 69 aa12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 NR2C1P13056 603 aa12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 PRSS3P35030 304 aa12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 STARP49675 285 aa12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 GFRA1P56159 465 aa12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 OPCMLQ14982 345 aa12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 KLHL24Q6TFL4 600 aa12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 OR6N1Q8NGY5 312 aa12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 NKD1Q969G9 470 aa12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 SFXN2Q96NB2 322 aa12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 ZNF416Q9BWM5 594 aa12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 B3GNT4Q9C0J1 378 aa12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 KCNK15Q9H427 330 aa12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 CKLFQ9UBR5 152 aa12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa12.2□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 ZNF716A6NP11 495 aa12.19□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 KDM4BO94953 1096 aa12.19□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 GTF2F2P13984 249 aa12.19□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 GDF1P27539 372 aa12.19□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 NTF4P34130 210 aa12.19□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 LSM6P62312 80 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 GLT8D1Q68CQ7 371 aa12.19□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 OR52B4Q8NGK2 314 aa12.19□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 HES7Q9BYE0 225 aa12.19□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 A0A1B0GTI1 187 aa12.19□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 L7N2F9 121 aa12.19□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 TRAPPC6AO75865 159 aa12.19□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 PDGFAP04085 211 aa12.19□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 VSIG10L2P0DP72 767 aa12.19□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 CARD18P57730 90 aa12.19□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 GUCA2AQ02747 115 aa12.19□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 ABHD17BQ5VST6 288 aa12.19□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa12.19□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 SIGIRRQ6IA17 410 aa12.19□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa12.19□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 C20orf196Q8IYI0 205 aa12.19□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 OR2M7Q8NG81 312 aa12.19□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 SUN5Q8TC36 379 aa12.19□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 ELMOD3Q96FG2 381 aa12.19□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 GSX2Q9BZM3 304 aa12.19□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa12.19□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa12.18□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 TUBAL3A6NHL2 446 aa12.18□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 DHHO43323 396 aa12.18□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 CXCL13O43927 109 aa12.18□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 RLN1P04808 185 aa12.18□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 CXCL2P19875 107 aa12.18□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 MSR1P21757 451 aa12.18□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 COMMD7Q86VX2 200 aa12.18□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 OR4D10Q8NGI6 311 aa12.18□□□□□ -0.46
TNS1-210ENST00000446903 OR2V1Q8NHB1 315 aa12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.7 ms