RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 ACOD1A6NK06 481 aa14.31□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 ANKRD65E5RJM6 399 aa14.31□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 PHYHO14832 338 aa14.31□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 TACSTD2P09758 323 aa14.31□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 SBK2P0C263 348 aa14.31□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC2A1P11166 492 aa14.31□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 DDOSTP39656 456 aa14.31□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 OCLNQ16625 522 aa14.31□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 GLYATL3Q5SZD4 288 aa14.31□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 MEDAGQ5VYS4 303 aa14.31□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 USP51Q70EK9 711 aa14.31□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 KRT77Q7Z794 578 aa14.31□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF679Q8IYX0 411 aa14.31□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 OR5AS1Q8N127 324 aa14.31□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa14.31□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 OR2Z1Q8NG97 314 aa14.31□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 UBE2FQ969M7 185 aa14.31□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 SGK3Q96BR1 496 aa14.31□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 MROQ9BYG7 248 aa14.31□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC22A4Q9H015 551 aa14.31□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 RGCCQ9H4X1 137 aa14.31□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 CLN6Q9NWW5 311 aa14.31□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa14.3□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 C5orf63A6NC05 138 aa14.3□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 CD300LBA8K4G0 201 aa14.3□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC16A6O15403 523 aa14.3□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 LILRA1O75019 489 aa14.3□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 OR2T7P0C7T2 308 aa14.3□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 TNFRSF1AP19438 455 aa14.3□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 CFL1P23528 166 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 RCN1Q15293 331 aa14.3□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 HFEQ30201 348 aa14.3□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 LRRN1Q6UXK5 716 aa14.3□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC35F2Q8IXU6 374 aa14.3□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 PACRGLQ8N7B6 248 aa14.3□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 OR2T27Q8NH04 317 aa14.3□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 ITFG2Q969R8 447 aa14.3□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 OR8B4Q96RC9 309 aa14.3□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 OR10A2Q9H208 303 aa14.3□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM118AQ9NWS6 357 aa14.3□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP14.3□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 COPS3Q9UNS2 423 aa14.3□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 GMPPBQ9Y5P6 360 aa14.3□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa14.29□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 GGT3PA6NGU5 568 aa14.29□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa14.29□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 MPZL2O60487 215 aa14.29□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 CDC14BO60729 498 aa14.29□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 ANOS1P23352 680 aa14.29□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 EGR3Q06889 387 aa14.29□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 KRTAP1-1Q07627 177 aa14.29□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC3A1Q07837 685 aa14.29□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM249Q2WGJ8 235 aa14.29□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM57BQ71RH2 274 aa14.29□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 OR2AE1Q8NHA4 323 aa14.29□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 PGAM5Q96HS1 289 aa14.29□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa14.29□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF319Q9P2F9 582 aa14.29□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF391Q9UJN7 358 aa14.29□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 LRP12Q9Y561 859 aa14.29□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa14.29□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 SNTNA6NMZ2 147 aa14.28□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 DLGAP1O14490 977 aa14.28□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 TBX1O43435 398 aa14.28□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 GABRB1P18505 474 aa14.28□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 MMP16P51512 607 aa14.28□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 CHN2P52757 468 aa14.28□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 RIDAP52758 137 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM3AP98173 230 aa14.28□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 TRIP10Q15642 601 aa14.28□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 TIGD6Q17RP2 521 aa14.28□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 KLBQ86Z14 1044 aa14.28□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa14.28□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 OR51G2Q8NGK0 314 aa14.28□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 RHOXF1Q8NHV9 184 aa14.28□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 CCL17Q92583 94 aa14.28□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 HPS1Q92902 700 aa14.28□□□□□ -0.12
RABGEF1-204ENST00000442563 PRR32B1ATL7 298 aa14.27□□□□□ -0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 CLDN25C9JDP6 229 aa14.27□□□□□ -0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 IFNL4K9M1U5 179 aa14.27□□□□□ -0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 MLNRO43193 412 aa14.27□□□□□ -0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 PPIHO43447 177 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 CD5LO43866 347 aa14.27□□□□□ -0.13
RABGEF1-204ENST00000442563 GMDSO60547 372 aa14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms