RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440447.2

PTX4-202, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTX4, Length 1,117 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-202ENST00000440447 J3QRE1 110 aa15.6■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 SSX4O60224 188 aa15.6■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 FADS2O95864 444 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 MMP15P51511 669 aa15.6■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 ZNF92Q03936 586 aa15.6■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 RAB40BQ12829 278 aa15.6■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 TESK1Q15569 626 aa15.6■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 TIGD6Q17RP2 521 aa15.6■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 IZUMO2Q6UXV1 221 aa15.6■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 SSX6Q7RTT6 188 aa15.6■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 THAP5Q7Z6K1 395 aa15.6■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 OR5AS1Q8N127 324 aa15.6■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 ACBD7Q8N6N7 88 aa15.6■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 YIPF7Q8N8F6 280 aa15.6■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 OR2AE1Q8NHA4 323 aa15.6■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 OPA3Q9H6K4 179 aa15.6■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 CCDC168Q8NDH2 2452 aa15.6■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 USF3Q68DE3 2245 aa15.59■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 METTL15A6NJ78 407 aa15.59■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 ANOS1P23352 680 aa15.59■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 VHLP40337 213 aa15.59■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 HSPA13P48723 471 aa15.59■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 ZNF85Q03923 595 aa15.59■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 CDK5R2Q13319 367 aa15.59■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 PCGF3Q3KNV8 242 aa15.59■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa15.59■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 SGK3Q96BR1 496 aa15.59■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 REEP6Q96HR9 211 aa15.59■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 MSL2Q9HCI7 577 aa15.59■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 FAM206AQ9NX38 181 aa15.59■□□□□ 0.09
PTX4-202ENST00000440447 IRGMA1A4Y4 181 aa15.58■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 GGT3PA6NGU5 568 aa15.58■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa15.58■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 IQCF6A8MYZ5 107 aa15.58■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 SPRY3O43610 288 aa15.58■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 SULT1C4O75897 302 aa15.58■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 CFL1P23528 166 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 MMP16P51512 607 aa15.58■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 CLEC12BQ2HXU8 276 aa15.58■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 GFOD2Q3B7J2 385 aa15.58■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 ZNF684Q5T5D7 378 aa15.58■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 FAM220AQ7Z4H9 259 aa15.58■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa15.58■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 OR8G5Q8NG78 346 aa15.58■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 OR52I1Q8NGK6 324 aa15.58■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 SPSB4Q96A44 273 aa15.58■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 DIRC2Q96SL1 478 aa15.58■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 RGCCQ9H4X1 137 aa15.58■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa15.58■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 ZNF319Q9P2F9 582 aa15.58■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa15.58■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 CD300LBA8K4G0 201 aa15.57■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa15.57■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 LY6HO94772 140 aa15.57■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 RPP14O95059 124 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 IGHV1-46P01743 117 aa15.57■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 MAGEB1P43366 347 aa15.57■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 PRSS12P56730 875 aa15.57■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 TSTQ16762 297 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 CLEC2AQ6UVW9 174 aa15.57■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa15.57■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 BHLHE23Q8NDY6 225 aa15.57■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 WFDC11Q8NEX6 87 aa15.57■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 OR8B12Q8NGG6 310 aa15.57■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 FBLIM1Q8WUP2 373 aa15.57■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 PBOV1Q9GZY1 135 aa15.57■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 MOB1AQ9H8S9 216 aa15.57■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 INPP5EQ9NRR6 644 aa15.57■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 DECR2Q9NUI1 292 aa15.57■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 ZNF391Q9UJN7 358 aa15.57■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 GNG8Q9UK08 70 aa15.57■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa15.57■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 MYRFQ9Y2G1 1151 aa15.57■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 R4GMQ9 66 aa15.57■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 MAST4O15021 2626 aa15.57■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 AKAP9Q99996 3911 aa15.56■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 IGHA1P01876 353 aa15.56■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 TACSTD2P09758 323 aa15.56■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 CSF3P09919 207 aa15.56■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 DAOP14920 347 aa15.56■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 TNFSF4P23510 183 aa15.56■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 DDOSTP39656 456 aa15.56■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 DSCR9P59020 149 aa15.56■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 ACTA2P62736 377 aa15.56■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 ACTG2P63267 376 aa15.56■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 CCL8P80075 99 aa15.56■□□□□ 0.08
PTX4-202ENST00000440447 CDONQ4KMG0 1287 aa15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.4 ms