RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 ISXQ2M1V0 245 aa16.27■□□□□ 0.19
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PTPRJ-202ENST00000440289 SPP1P10451 314 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRJ-202ENST00000440289 HSF1Q00613 529 aa16.24■□□□□ 0.19
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