RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437713.5

TTC28-AS1-216, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 854 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OR52H1Q8NGJ2 320 aa6.91□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OR10S1Q8NGN2 331 aa6.91□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PYDC1Q8WXC3 89 aa6.91□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RAB1CQ92928 201 aa6.91□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 YIPF5Q969M3 257 aa6.91□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ERGIC1Q969X5 290 aa6.91□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TIMD4Q96H15 378 aa6.91□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MNTQ99583 582 aa6.91□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC30A2Q9BRI3 323 aa6.91□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 COPS4Q9BT78 406 aa6.91□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ABHD6Q9BV23 337 aa6.91□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GABARAPL3Q9BY60 117 aa6.91□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 YIPF3Q9GZM5 350 aa6.91□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa6.91□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 POFUT1Q9H488 388 aa6.91□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MED20Q9H944 212 aa6.91□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MSL2Q9HCI7 577 aa6.91□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMEM100Q9NV29 134 aa6.91□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HAO2Q9NYQ3 351 aa6.91□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 USE1Q9NZ43 259 aa6.91□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PTTG3PQ9NZH4 202 aa6.91□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OAZ3Q9UMX2 235 aa6.91□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ORC6Q9Y5N6 252 aa6.91□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa6.91□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CR1P17927 2039 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CLDN25C9JDP6 229 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 H3BNX3 289 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PPIHO43447 177 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CDC14BO60729 498 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF254O75437 659 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 H2BFMP0C1H6 154 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IGHV4-31P0DP07 118 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ANPEPP15144 967 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ALOX5APP20292 161 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CPT2P23786 658 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HSD11B1P28845 292 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DCTDP32321 178 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OPRL1P41146 370 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC6A9P48067 706 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SRP9P49458 86 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RAD23AP54725 363 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RPS7P62081 194 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMED1Q13445 227 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 APOFQ13790 326 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NXNL2Q5VZ03 156 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 C12orf73Q69YU5 71 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OR2T2Q6IF00 324 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 Q71RC1 249 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC16A9Q7RTY1 509 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NAA40Q86UY6 237 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KLBQ86Z14 1044 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GID4Q8IVV7 300 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF283Q8N7M2 679 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SPERTQ8NA61 448 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OR2Z1Q8NG97 314 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMEM163Q8TC26 289 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ASB17Q8WXJ9 295 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SPSB4Q96A44 273 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CIB1Q99828 191 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RGCCQ9H4X1 137 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 S100A14Q9HCY8 104 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 YAE1D1Q9NRH1 226 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF391Q9UJN7 358 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LAMP5Q9UJQ1 280 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-216ENST00000437713 C2CD3Q4AC94 2353 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TLN2Q9Y4G6 2542 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GGT3PA6NGU5 568 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CD300LBA8K4G0 201 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-216ENST00000437713 B4DSR2 109 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PHYHO14832 338 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PRKYO43930 277 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GMDSO60547 372 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LMX1BO60663 402 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MITFO75030 526 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CRLF1O75462 422 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FSTL3O95633 263 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ALPLP05186 524 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-216ENST00000437713 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-216ENST00000437713 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PSKH1P11801 424 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PCMT1P22061 227 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ALDH3A2P51648 485 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PRKXP51817 358 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CDC42P60953 191 aa6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms