RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		14.85	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	PGAP1	Q75T13	922 aa		14.85	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		14.85	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	OR2T33	Q8NG76	320 aa		14.85	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		14.85	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		14.85	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		14.85	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	ASB9	Q96DX5	294 aa		14.85	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	C1orf21	Q9H246	121 aa		14.85	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	REEP1	Q9H902	201 aa		14.85	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		14.85	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	14.85	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738		U3KQV3	271 aa		14.85	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	HKR1	P10072	659 aa		14.84	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	FPR2	P25090	351 aa		14.84	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	CD200	P41217	278 aa		14.84	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	ENTPD1	P49961	510 aa		14.84	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	GK3P	Q14409	553 aa		14.84	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	ESCO2	Q56NI9	601 aa		14.84	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	TEX30	Q5JUR7	227 aa		14.84	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	DRAM2	Q6UX65	266 aa		14.84	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		14.84	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		14.84	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		14.84	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738		Q8TCH9	128 aa		14.84	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	SPTSSA	Q969W0	71 aa		14.84	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	ERGIC1	Q969X5	290 aa		14.84	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	NTN4	Q9HB63	628 aa		14.84	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		14.84	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		14.84	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		14.83	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF205	O95201	554 aa		14.83	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	SOX14	O95416	240 aa		14.83	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	14.83	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	GYPB	P06028	91 aa		14.83	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	CLU	P10909	449 aa		14.83	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	SPI1	P17947	270 aa		14.83	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	FMO3	P31513	532 aa		14.83	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF92	Q03936	586 aa		14.83	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF404	Q494X3	552 aa		14.83	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		14.83	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		14.83	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF511	Q8NB15	262 aa		14.83	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	14.83	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		14.83	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		14.83	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	AUP1	Q9Y679	476 aa		14.83	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	C5orf63	A6NC05	138 aa		14.82	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		14.82	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	LRRC30	A6NM36	301 aa		14.82	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	CD300LB	A8K4G0	201 aa		14.82	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	ACOT8	O14734	319 aa		14.82	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	RAP2A	P10114	183 aa		14.82	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	PAX8	Q06710	450 aa		14.82	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	14.82	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM201A	Q5SY85	155 aa		14.82	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	14.82	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	KLB	Q86Z14	1044 aa		14.82	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		14.82	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		14.82	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		14.82	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		14.82	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNJ15	Q99712	375 aa		14.82	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	14.82	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC22A4	Q9H015	551 aa		14.82	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	CMC2	Q9NRP2	79 aa		14.82	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	MIOX	Q9UGB7	285 aa		14.82	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		14.82	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	14.81	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	SPARC	P09486	303 aa		14.81	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		14.81	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	14.81	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	BLVRA	P53004	296 aa		14.81	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	DEFA6	Q01524	100 aa		14.81	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	MPPED2	Q15777	294 aa		14.81	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		14.81	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		14.81	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		14.81	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	14.81	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		14.81	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	14.81	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	COPS4	Q9BT78	406 aa		14.81	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	CHID1	Q9BWS9	393 aa		14.81	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	14.81	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	NUP50	Q9UKX7	468 aa		14.81	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		14.81	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF878	C9JN71	531 aa		14.8	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	GMDS	O60547	372 aa		14.8	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM20B	O75063	409 aa		14.8	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	IFNG	P01579	166 aa		14.8	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF3	P17036	446 aa		14.8	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	CA6	P23280	308 aa		14.8	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	CD80	P33681	288 aa		14.8	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		14.8	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	14.8	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		14.8	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	GIPC3	Q8TF64	312 aa		14.8	□□□□□ -0.04
MRPL28-203	ENST00000429738	SPSB4	Q96A44	273 aa		14.8	□□□□□ -0.04

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