RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 C1orf100Q5SVJ3 147 aa20.37■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa20.37■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 FNDC9Q8TBE3 224 aa20.37■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 SORCS2Q96PQ0 1159 aa20.37■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa20.36■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 CD46P15529 392 aa20.36■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 HLA-DMAP28067 261 aa20.36■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 CPT1CQ8TCG5 803 aa20.36■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 LYZL4Q96KX0 146 aa20.36■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 FRYQ5TBA9 3013 aa20.36■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 CTSSP25774 331 aa20.36■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 SFRP5Q5T4F7 317 aa20.36■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF774Q6NX45 483 aa20.36■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF627Q7L945 461 aa20.36■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 FAM46BQ96A09 425 aa20.36■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 MCUBQ9NWR8 336 aa20.36■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 M0R135 149 aa20.35■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 SGCEO43556 437 aa20.35■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF799Q96GE5 643 aa20.35■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 FOXB1Q99853 325 aa20.35■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 DEFB127Q9H1M4 99 aa20.35■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 GPR35Q9HC97 309 aa20.35■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa20.35■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 PTPRBP23467 1997 aa20.35■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa20.35■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 ECDO95905 644 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 LIPCP11150 499 aa20.35■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 CCL11P51671 97 aa20.35■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 TSPO2Q5TGU0 170 aa20.35■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF529Q6P280 563 aa20.35■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 DOK3Q7L591 496 aa20.35■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 MEIOBQ8N635 442 aa20.35■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 C15orf40Q8WUR7 153 aa20.35■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 SLC17A5Q9NRA2 495 aa20.35■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa20.35■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 A0A0A6YYJ9 748 aa20.34■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 LDLRAD4O15165 306 aa20.34■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 ALDOBP05062 364 aa20.34■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 TRAPPC2P0DI81 140 aa20.34■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 TRAPPC2BP0DI82 140 aa20.34■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF32P17041 273 aa20.34■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 CCL1P22362 96 aa20.34■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 RRADP55042 308 aa20.34■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 KCNJ8Q15842 424 aa20.34■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 MOGAT2Q3SYC2 334 aa20.34■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF766Q5HY98 468 aa20.34■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 RNFT1Q5M7Z0 435 aa20.34■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 TUSC5Q8IXB3 177 aa20.34■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 SLC22A24Q8N4F4 322 aa20.34■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 AKR7LQ8NHP1 331 aa20.34■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 FGFBP3Q8TAT2 258 aa20.34■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 RNF170Q96K19 258 aa20.34■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 CALHM2Q9HA72 323 aa20.34■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 BEX1Q9HBH7 125 aa20.34■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 AP3S2P59780 193 aa20.33■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 PMPCAQ10713 525 aa20.33■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 SNAI3Q3KNW1 292 aa20.33■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 C9orf135Q5VTT2 229 aa20.33■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 MYO7BQ6PIF6 2116 aa20.33■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 OR5AS1Q8N127 324 aa20.33■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
FAAP20-209ENST00000428120 TNFRSF10AO00220 468 aa20.33■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 SYNGR4O95473 234 aa20.33■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 GABRA1P14867 456 aa20.33■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 BTG1P62324 171 aa20.33■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 CBX3Q13185 183 aa20.33■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 PCGF3Q3KNV8 242 aa20.33■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 ACBD4Q8NC06 268 aa20.33■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 OR14K1Q8NGZ2 314 aa20.33■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 SPTSSAQ969W0 71 aa20.33■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 PRRG4Q9BZD6 226 aa20.33■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa20.33■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 CST2P09228 141 aa20.32■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 NEK6Q9HC98 313 aa20.32■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 FLVCR2Q9UPI3 526 aa20.32■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 SPTBN2O15020 2390 aa20.32■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 H7C417 338 aa20.32■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 SYNGR3O43761 229 aa20.32■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 RBBP9O75884 186 aa20.32■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 DHFRP00374 187 aa20.32■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 PMP22Q01453 160 aa20.32■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 HGFACQ04756 655 aa20.32■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 UNC119Q13432 240 aa20.32■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 SLC10A1Q14973 349 aa20.32■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 RAB35Q15286 201 aa20.32■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms