RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 CD74P04233 296 aa16.46■□□□□ 0.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ITGB2P05107 769 aa16.46■□□□□ 0.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GIPP09681 153 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF84P51523 738 aa16.46■□□□□ 0.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CARD18P57730 90 aa16.46■□□□□ 0.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
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