RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

BASIC

Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF665Q9H7R5 613 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 KRT84Q9NSB2 600 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM106BQ9NUM4 274 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 TREM2Q9NZC2 230 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF391Q9UJN7 358 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 NPTNQ9Y639 398 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa7.2□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 TANC2Q9HCD6 1990 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 PPIAL4EA0A075B759 164 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 GGT3PA6NGU5 568 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM183AA6NL82 134 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 CD300LBA8K4G0 201 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 PPIAL4DF5H284 164 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 J3QLI3 93 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 EBAG9O00559 213 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 IGHV2-5P01817 119 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 MSMBP08118 114 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 PPIAL4FP0DN26 164 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 SRD5A1P18405 259 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 IGFBP5P24593 272 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 HSD11B1P28845 292 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 IL2RGP31785 369 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 MDH2P40926 338 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 DAPP51397 102 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 PRKXP51817 358 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ACTR3P61158 418 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 RPS7P62081 194 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 CCNIQ14094 377 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 CR1LQ2VPA4 569 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 KLHL12Q53G59 568 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM255AQ5JRV8 349 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 KDM4DQ6B0I6 523 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ZFP1Q6P2D0 407 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 PLBD1Q6P4A8 553 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ASRGL1Q7L266 308 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 TIGD4Q8IY51 512 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 HS3ST5Q8IZT8 346 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 OR5AS1Q8N127 324 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 FTMTQ8N4E7 242 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 KLHL36Q8N4N3 616 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 OR11L1Q8NGX0 322 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 OTOSQ8NHW6 89 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ITLN1Q8WWA0 313 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 SPSB4Q96A44 273 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 MEGF10Q96KG7 1140 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 MNTQ99583 582 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 GAL3ST1Q99999 423 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ABHD6Q9BV23 337 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 OR10A2Q9H208 303 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 GCM1Q9NP62 436 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 PCDHB10Q9UN67 800 aa7.19□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A0G2JMP0 313 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A0X1KG70 313 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ISPDA4D126 451 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM178BH3BS89 294 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF254O75437 659 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 FOXH1O75593 365 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 IGHV2-70P01814 119 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 LYNP07948 512 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 H2BFMP0C1H6 154 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 SBK2P0C263 348 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 CLUP10909 449 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 IRF2P14316 349 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 DCTDP32321 178 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 SRP14P37108 136 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 OPRL1P41146 370 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 CD200P41217 278 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 CX3CR1P49238 355 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 BTG1P62324 171 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 TIGD6Q17RP2 521 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 AVPI1Q5T686 147 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 LYPD4Q6UWN0 246 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC16A9Q7RTY1 509 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 NAA40Q86UY6 237 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 PRIMA1Q86XR5 153 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 OR4M2Q8NGB6 313 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 Q8TCH9 128 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 THEM6Q8WUY1 208 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ASB17Q8WXJ9 295 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 TEAD3Q99594 435 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 SOX7Q9BT81 388 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 NARFLQ9H6Q4 476 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 MED20Q9H944 212 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 ABCB9Q9NP78 766 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 TRIM36Q9NQ86 728 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 C14orf119Q9NWQ9 140 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 HIF1ANQ9NWT6 349 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 TVP23BQ9NYZ1 205 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 MIOXQ9UGB7 285 aa7.18□□□□□ -1.26
MT-TS1-201ENST00000387416 LAMP5Q9UJQ1 280 aa7.18□□□□□ -1.26
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