RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRPHP41219 470 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 TAS2R43P59537 309 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 ILKQ13418 452 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 CHRNA6Q15825 494 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 PSMD5Q16401 504 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 SP6Q3SY56 376 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM107Q6UX40 140 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 CERS6Q6ZMG9 384 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 CMTM1Q8IZ96 169 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 LRRC75AQ8NAA5 344 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZBTB18Q99592 522 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 ANKRD60Q9BZ19 345 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP1.05□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 HYPKQ9NX55 129 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 TAS2R5Q9NYW4 299 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 BLOC1S6Q9UL45 172 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 LRRC42Q9Y546 428 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZBED9Q6R2W3 1325 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 FHOD3Q2V2M9 1422 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRIP11Q15643 1979 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 BICDL2A1A5D9 508 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 CLDN11O75508 207 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 CT45A6P0DMU7 189 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 CT45A5P0DMU8 189 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 CT45A7P0DMV0 189 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP1.04□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 ACOT2P49753 483 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 ACLYP53396 1101 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP1.04□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 SEMG2Q02383 582 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 CHIT1Q13231 466 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 PPP1R7Q15435 360 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 CT45A1Q5HYN5 189 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 CPTPQ5TA50 214 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 RTL4Q6ZR62 310 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 CMC1Q7Z7K0 106 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR1L1Q8NH94 360 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 CT45A3Q8NHU0 189 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 NUBPLQ8TB37 319 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 HAUS1Q96CS2 278 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 RNF145Q96MT1 663 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 C18orf15Q96N68 181 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP1.04□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 DYRK4Q9NR20 520 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 HMGXB4Q9UGU5 601 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 RWDD2AQ9UIY3 292 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP1.04□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 TSPOAP1O95153 1857 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 SDHAF1A6NFY7 115 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 CENPBD1B2RD01 187 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP1.03□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 CLDN34H7C241 214 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 NMT2O60551 498 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC22O60826 627 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 SERPINE2P07093 398 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP1.03□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC1A1P43005 524 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP1.03□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 HNMTP50135 292 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 NDUFA8P51970 172 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZMYND11Q15326 602 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 WDR59Q6PJI9 974 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 OPN5Q6U736 354 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM131AQ6UXB0 335 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 CD300LGQ6UXG3 332 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 NECAB1Q8N987 351 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 LY6G5BQ8NDX9 201 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC26A10Q8NG04 563 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP1.03□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 NRBF2Q96F24 287 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 CSPG4P5Q96PW8 444 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP1.03□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 RACGAP1Q9H0H5 632 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP1.03□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 RAB23Q9ULC3 237 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-38P-201ENST00000384085 A8MWL6 223 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 OVOL1O14753 267 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 CLOCKO15516 846 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 PLXNB1O43157 2135 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 AQP9O43315 295 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 FSTL3O95633 263 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP1.02□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC2A3P11169 496 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP1.02□□□□□ -2.25
RNU6-38P-201ENST00000384085 HTR1DP28221 377 aa1.02□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms