RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 SMARCD1Q96GM5 515 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 SAMD8Q96LT4 415 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 OR5B2Q96R09 309 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 OR4K3Q96R72 315 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 NLNQ9BYT8 704 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 POTEKPQ9BYX7 375 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 ACPTQ9BZG2 426 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 TM6SF2Q9BZW4 377 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 ARL6Q9H0F7 186 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF700Q9H0M5 742 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 C20orf85Q9H1P6 137 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 OR52A5Q9H2C5 316 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 UBQLN3Q9H347 655 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 C1orf198Q9H425 327 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 REEP1Q9H902 201 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 AMBNQ9NP70 447 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 IL26Q9NPH9 171 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 MMP26Q9NRE1 261 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 SLC6A13Q9NSD5 602 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 UQCC1Q9NVA1 299 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 CLN6Q9NWW5 311 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 TAS2R3Q9NYW6 316 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 CLEC2DQ9UHP7 191 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 A4GNTQ9UNA3 340 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 SLC22A14Q9Y267 594 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 SLC5A10A0PJK1 596 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 IRGMA1A4Y4 181 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 OR6C76A6NM76 312 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 IQCF5A8MTL0 148 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 C9J4A7 227 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 ANHXE9PGG2 379 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 I3L1I5 382 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 PRRG1O14668 218 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 OR10H2O60403 315 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 OR1I1O60431 355 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 GPR137BO60478 399 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 TSPAN3O60637 253 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 GGCTO75223 188 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 ENTPD6O75354 484 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 CLDN11O75508 207 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 SLCO2B1O94956 709 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 RPP14O95059 124 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 NDUFB6O95139 128 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 KCNK5O95279 499 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 PRAMEF12O95522 483 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 AGR2O95994 175 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 C8GP07360 202 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 FCGR3AP08637 254 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 ANXA5P08758 320 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 LINC00032P0C843 101 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 CLUP10909 449 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 NQO2P16083 231 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 SDC1P18827 310 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 NFYBP25208 207 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 AGTR1P30556 359 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 OR1E1P30953 314 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 KDELR2P33947 212 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 MPIP34949 423 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 BMI1P35226 326 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 FEN1P39748 380 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 CDKN2CP42773 168 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 OMPP47874 163 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 CSNK1DP48730 415 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 PITPNBP48739 271 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 CAV2P51636 162 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 CCR4P51679 360 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 CRISP1P54107 249 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 H2BFSP57053 126 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 CARD18P57730 90 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 RPS20P60866 119 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 CDC42P60953 191 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 TSPAN31Q12999 210 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 IL18Q14116 193 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 OR4D1Q15615 310 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 HMGN3Q15651 99 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 NDUFA9Q16795 377 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 ISXQ2M1V0 245 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 C15orf32Q32M92 178 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 NDUFAF6Q330K2 333 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 MAJINQ3KP22 176 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 LY6G6FQ5SQ64 297 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 CYB5R2Q6BCY4 276 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 C22orf42Q6IC83 251 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 ULK3Q6PHR2 472 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 LRRN1Q6UXK5 716 aa3□□□□□ -1.93
PTPRC-202ENST00000367364 HEPN1Q6WQI6 88 aa3□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 157.1 ms