RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362817.1

RNU1-38P-201, Transcript of RNA, U1 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU1-38P, Length 144 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU1-38P-201ENST00000362817 CLUP10909 449 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 ANXA8P13928 327 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF250P15622 560 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 GRK5P34947 590 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 GGT2P36268 569 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 RAD52P43351 418 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 ALDH3B1P43353 468 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 HTR5AP47898 357 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 GDI2P50395 445 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 DAPP51397 102 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 EFNA4P52798 201 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC25A1P53007 311 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 ACTR3P61158 418 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 RPS23P62266 143 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 HIST1H3AP68431 136 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 CDK5Q00535 292 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 GLO1Q04760 184 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 SCRN3Q0VDG4 424 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC18B1Q6NT16 456 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 ACSM5Q6NUN0 579 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAHD1Q6P587 224 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 CORO6Q6QEF8 472 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 CFAP77Q6ZQR2 320 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 HIST2H3AQ71DI3 136 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 AMIGO2Q86SJ2 522 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF525Q8N782 197 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 ATG16L2Q8NAA4 619 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR51L1Q8NGJ5 315 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR1J1Q8NGS3 322 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR5K1Q8NHB7 308 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 TEX47Q8TBZ9 253 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 LRTOMTQ8WZ04 291 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC7A6Q92536 515 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 C18orf12Q96KH6 178 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 C4orf45Q96LM5 186 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 SMR3AQ99954 134 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 HCAR1Q9BXC0 346 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 BCL2L14Q9BZR8 327 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF556Q9HAH1 456 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 CMC2Q9NRP2 79 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 PLEK2Q9NYT0 353 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 KLHL21Q9UJP4 597 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 TVP23AA6NH52 213 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM183AA6NL82 134 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 MITFO75030 526 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 IFNGP01579 166 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 HLA-DQA2P01906 255 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 GYPBP06028 91 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 CD1AP06126 327 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 ADRA2AP08913 450 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF3P17036 446 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 SPI1P17947 270 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 FASP25445 335 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 POU1F1P28069 291 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 MPV17P39210 176 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 RPS27P42677 84 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 ARHGDIAP52565 204 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 GINS1Q14691 196 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 ALKBH6Q3KRA9 238 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 ELFN2Q5R3F8 820 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 SPATA46Q5T0L3 261 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 LINC01590Q5TEZ4 76 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM236Q5W0B7 351 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC27A4Q6P1M0 643 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 HIPK1Q86Z02 1210 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 LINC00346Q8IVM7 164 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 ICA1LQ8NDH6 482 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 PROKR2Q8NFJ6 384 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 GJC3Q8NFK1 279 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR2T4Q8NH00 348 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR1F12Q8NHA8 337 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 SYNPRQ8TBG9 265 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 PYDC1Q8WXC3 89 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 PTP4A1Q93096 173 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 COQ7Q99807 217 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR2J1Q9GZK6 312 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 TPK1Q9H3S4 243 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 MED20Q9H944 212 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 WDR76Q9H967 626 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC25A19Q9HC21 320 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RNU1-38P-201ENST00000362817 TAAR3PQ9P1P4 343 aa6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms