RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 CD37P11049 281 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 GP2P55259 537 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 H3F3AP84243 136 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 TRILQ7L0X0 811 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 TOX2Q96NM4 488 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 EDEM2Q9BV94 578 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 MARCH5Q9NX47 278 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 MED29Q9NX70 200 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 PMS2P1A4D2B8 440 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 OR4E1P0C645 316 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 SMIM17P0DL12 118 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 NME1P15531 152 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 HAAOP46952 286 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 DIO1P49895 249 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 FAM162BQ5T6X4 162 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 FAM26EQ8N5C1 309 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 GPX8Q8TED1 209 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 MED18Q9BUE0 208 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 ZBP1Q9H171 429 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 OR5H8P0DN80 308 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 TMEM18Q96B42 140 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 PLEKHA2Q9HB19 425 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 SLC22A13Q9Y226 551 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 CXCL16Q9H2A7 254 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 FBXO34Q9NWN3 711 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 RRASP10301 218 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 PIGPP57054 158 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 SELENBP1Q13228 472 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 PATE1Q8WXA2 126 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 PBOV1Q9GZY1 135 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 LAT2Q9GZY6 243 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 M0QZ24 198 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 XRCC2O43543 280 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 CXCL13O43927 109 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 SCGB1C2P0DMR2 95 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 FGF7P21781 194 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 CST9Q5W186 159 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 CLEC9AQ6UXN8 241 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 ZBTB44Q8NCP5 570 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 ERGIC1Q969X5 290 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 TAF1P21675 1872 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 ZBTB42B2RXF5 422 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 B3GALNT1O75752 331 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 TGFBR1P36897 503 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 SLC19A1P41440 591 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 ADPRHP54922 357 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 MYBPHQ13203 477 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 ALKBH6Q3KRA9 238 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 ZNF528Q3MIS6 628 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 TARM1B6A8C7 271 aa14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 HRO43593 1189 aa14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 AMTP48728 403 aa14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 RAB1AP62820 205 aa14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 XKR7Q5GH72 579 aa14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 DEFB123Q8N688 67 aa14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 TNFSF11O14788 317 aa14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 PNPP00491 289 aa14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 SOX18P35713 384 aa14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 PYCR3Q53H96 274 aa14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 PARM1Q6UWI2 310 aa14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 TAAR6Q96RI8 345 aa14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 CHST6Q9GZX3 395 aa14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 ZNF17P17021 662 aa14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 BTG2P78543 158 aa14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 SHBQ15464 509 aa14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 DMRTC1Q5HYR2 192 aa14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 OR2T2Q6IF00 324 aa14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 LRFN3Q9BTN0 628 aa14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 DCAF16Q9NXF7 216 aa14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 LAMP3Q9UQV4 416 aa14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 CD1EP15812 388 aa14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 IRS1P35568 1242 aa14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 TMEM88Q6PEY1 159 aa14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 SLC25A26Q70HW3 274 aa14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 OR2T6Q8NHC8 308 aa14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 TGOLN2O43493 480 aa14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 SPP1P10451 314 aa14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 USF1P22415 310 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 EGR3Q06889 387 aa14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 MOB3AQ96BX8 217 aa14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 ACY3Q96HD9 319 aa14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 C2orf50Q96LR7 162 aa14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 R4GMQ9 66 aa14.56□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 SHISA7A6NL88 538 aa14.55□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 TNFRSF10CO14798 259 aa14.55□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 TMPRSS11DO60235 418 aa14.55□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 RFC3P40938 356 aa14.55□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 CLDN15P56746 228 aa14.55□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 DUSP8Q13202 625 aa14.55□□□□□ -0.08
RXRA-201ENST00000356384 BAP18Q8IXM2 172 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms