RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349984.6

CCR6-202, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 2,980 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-202ENST00000349984 CCL4P13236 92 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 OR1E2P47887 323 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 ART1P52961 327 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 SPIBQ01892 262 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 RHEBQ15382 184 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 RAB11BQ15907 218 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 DHRS11Q6UWP2 260 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 C1orf87Q8N0U7 546 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 OR5L1Q8NGL2 311 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 OR13C2Q8NGS9 318 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 OR14L1PQ8NHC6 308 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 FAM222BQ8WU58 562 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 RGMAQ96B86 450 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 TSSK3Q96PN8 268 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 TPT1P8Q9HAU6 139 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 FOXJ3Q9UPW0 622 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 PSG11Q9UQ72 335 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 CCL27Q9Y4X3 112 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa6.5□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 A0A1W2PR48 441 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 AQP7O14520 342 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 KLK8O60259 260 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 OR2F2O95006 317 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 TGFB1P01137 390 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 TK1P04183 234 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 CD1BP29016 333 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 TFPI2P48307 235 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 GFERP55789 205 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 DCAF7P61962 342 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 PMP22Q01453 160 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 OR2F1Q13607 317 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 RPE65Q16518 533 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 ZNF621Q6ZSS3 439 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 ZNF546Q86UE3 836 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 CPOQ8IVL8 374 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 GABRG1Q8N1C3 465 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 OR5M8Q8NGP6 311 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 OR51A7Q8NH64 312 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 THEM6Q8WUY1 208 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 RNF141Q8WVD5 230 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 BPIFA2Q96DR5 249 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 SPXQ9BT56 116 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 DUSP23Q9BVJ7 150 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 OR10A4Q9H209 315 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 ARV1Q9H2C2 271 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 LRTM1Q9HBL6 345 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 POMT1Q9Y6A1 747 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 SCGNO76038 276 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 OPN1SWP03999 348 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 OR4A8P0C604 315 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 CD1CP29017 333 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 MC4RP32245 332 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 BLKP51451 505 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 RAB1AP62820 205 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 RPS25P62851 125 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 CRMP1Q14194 572 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 TAF9Q16594 264 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 MST1LQ2TV78 715 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 ZNF750Q32MQ0 723 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 TTLL9Q3SXZ7 439 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 ELFN2Q5R3F8 820 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 PHF19Q5T6S3 580 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 PGBD2Q6P3X8 592 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 TMEM220Q6QAJ8 160 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 SYT9Q86SS6 491 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 TMPRSS12Q86WS5 348 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 ZNF100Q8IYN0 542 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 OR1J1Q8NGS3 322 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 OR4L1Q8NH43 312 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 CTHRC1Q96CG8 243 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 APIPQ96GX9 242 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 SLC35E1Q96K37 410 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 OR8D2Q9GZM6 311 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa6.49□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 A0A1W2PPE2 198 aa6.48□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 A6NIN4 97 aa6.48□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 DHRS7CA6NNS2 312 aa6.48□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 MPZL2O60487 215 aa6.48□□□□□ -1.37
CCR6-202ENST00000349984 ETFAP13804 333 aa6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms