RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 NRG4Q8WWG1 115 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM203Q969S6 136 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 SPOCK3Q9BQ16 436 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 DGCR6LQ9BY27 220 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 LIME1Q9H400 295 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 SLC17A5Q9NRA2 495 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 GPR173Q9NS66 373 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa3.88□□□□□ -1.79
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PTPRC-201ENST00000348564 TBCCD1Q9NVR7 557 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF835Q9Y2P0 537 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
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PTPRC-201ENST00000348564 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa3.88□□□□□ -1.79
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PTPRC-201ENST00000348564 PITPNBP48739 271 aa3.88□□□□□ -1.79
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PTPRC-201ENST00000348564 SMIM21Q3B7S5 101 aa3.88□□□□□ -1.79
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PTPRC-201ENST00000348564 RNF220Q5VTB9 566 aa3.88□□□□□ -1.79
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF565Q8N9K5 539 aa3.88□□□□□ -1.79
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PTPRC-201ENST00000348564 OR4D6Q8NGJ1 314 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 OR6X1Q8NH79 312 aa3.88□□□□□ -1.79
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PTPRC-201ENST00000348564 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 LRCH1Q9Y2L9 728 aa3.88□□□□□ -1.79
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PTPRC-201ENST00000348564 RPEQ96AT9 228 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 PPP1R14BQ96C90 147 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 CTHRC1Q96CG8 243 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 REEP6Q96HR9 211 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 OR2V2Q96R30 315 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 PSD2Q9BQI7 771 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM43Q9BTV4 400 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 PRDM14Q9GZV8 571 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM36Q9NQ86 728 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 SIRT7Q9NRC8 400 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 VPS13AQ96RL7 3174 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 SIRPB1O00241 398 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 ECDO95905 644 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 ALDOBP05062 364 aa3.87□□□□□ -1.79
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PTPRC-201ENST00000348564 CELP19835 753 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 PRKACBP22694 351 aa3.87□□□□□ -1.79
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PTPRC-201ENST00000348564 BPESC1Q9GZL8 116 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 COPS3Q9UNS2 423 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 WDFY4Q6ZS81 3184 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 CD300LBA8K4G0 201 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 MCRIP1C9JLW8 97 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 C19orf84I3L1E1 186 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
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