RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336767.5

BRIX1-201, Transcript of BRX1, biogenesis of ribosomes, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BRIX1, Length 1,926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIX1-201ENST00000336767 SCPEP1Q9HB40 452 aa14.71□□□□□ -0.05
BRIX1-201ENST00000336767 ZFP64Q9NPA5 681 aa14.71□□□□□ -0.05
BRIX1-201ENST00000336767 ZNF222Q9UK12 451 aa14.71□□□□□ -0.05
BRIX1-201ENST00000336767 RAB22AQ9UL26 194 aa14.71□□□□□ -0.05
BRIX1-201ENST00000336767 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa14.71□□□□□ -0.05
BRIX1-201ENST00000336767 C5orf63A6NC05 138 aa14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 OR5H15A6NDH6 313 aa14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 WIPF3A6NGB9 483 aa14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 CXCL13O43927 109 aa14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 IGLV3-1P01715 115 aa14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 METTL11BQ5VVY1 283 aa14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 SPINK14Q6IE38 97 aa14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 Q6ZTK2 550 aa14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 OR4D10Q8NGI6 311 aa14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 OR2V1Q8NHB1 315 aa14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 ULBP2Q9BZM5 246 aa14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 SLA2Q9H6Q3 261 aa14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 LRFN1Q9P244 771 aa14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 SLC5A6Q9Y289 635 aa14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 TRAPPC6AO75865 159 aa14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 BPNT1O95861 308 aa14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 AKAIN1P0CW23 69 aa14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 ANXA3P12429 323 aa14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 GTF2F2P13984 249 aa14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 ZNF84P51523 738 aa14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 GFRA1P56159 465 aa14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 ZP1P60852 638 aa14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 GALK2Q01415 458 aa14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 UNC119Q13432 240 aa14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 DOK3Q7L591 496 aa14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 RNF144BQ7Z419 303 aa14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 NAA40Q86UY6 237 aa14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 OR14K1Q8NGZ2 314 aa14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 MED30Q96HR3 178 aa14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 HYLS1Q96M11 299 aa14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 PRRX2Q99811 253 aa14.7□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 PCNX2A6NKB5 2137 aa14.69□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 SSNA1O43805 119 aa14.69□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 NEURL1O76050 574 aa14.69□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 IL5P05113 134 aa14.69□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 LPLP06858 475 aa14.69□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 VSIG8P0DPA2 414 aa14.69□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 GDF1P27539 372 aa14.69□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 FAM27BQ5VT28 67 aa14.69□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 PGAP1Q75T13 922 aa14.69□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 GLRX5Q86SX6 157 aa14.69□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa14.69□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 LRRC18Q8N456 261 aa14.69□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 OR10D3Q8NH80 312 aa14.69□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 ROBO4Q8WZ75 1007 aa14.69□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 ITFG2Q969R8 447 aa14.69□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 LYZL4Q96KX0 146 aa14.69□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 SEC22CQ9BRL7 303 aa14.69□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 FBLN5Q9UBX5 448 aa14.69□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 NPTNQ9Y639 398 aa14.69□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 RAB27BO00194 218 aa14.68□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 CD3DP04234 171 aa14.68□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 ACTBP60709 375 aa14.68□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 ACTG1P63261 375 aa14.68□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 TMEM53Q6P2H8 277 aa14.68□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 COMMD2Q86X83 199 aa14.68□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 TMEM229BQ8NBD8 167 aa14.68□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 AQP3Q92482 292 aa14.68□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 FBXO17Q96EF6 278 aa14.68□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 PGAM5Q96HS1 289 aa14.68□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa14.68□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 ING4Q9UNL4 249 aa14.68□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 CUL9Q8IWT3 2517 aa14.68□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa14.68□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa14.68□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 AKR7A2O43488 359 aa14.68□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 NDUFA5Q16718 116 aa14.68□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 ZNF260Q3ZCT1 412 aa14.68□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 STEAP1BQ6NZ63 245 aa14.68□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 CDH26Q8IXH8 852 aa14.68□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 GABRG1Q8N1C3 465 aa14.68□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 C9orf62Q8N4C0 152 aa14.68□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 ACBD4Q8NC06 268 aa14.68□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 OR2M7Q8NG81 312 aa14.68□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 FAM173AQ9BQD7 235 aa14.68□□□□□ -0.06
BRIX1-201ENST00000336767 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 129 ms