RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 SKA3Q8IX90 412 aa15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 NKAIN3Q8N8D7 197 aa15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 AKR7LQ8NHP1 331 aa15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 FCAMRQ8WWV6 532 aa15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 ATG5Q9H1Y0 275 aa15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 CNTD2Q9H8S5 307 aa15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 PLEKHA1Q9HB21 404 aa15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 TMEM138Q9NPI0 162 aa15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 SLC17A5Q9NRA2 495 aa15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 SLC7A10Q9NS82 523 aa15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 M0R135 149 aa15.67■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 OR14K1Q8NGZ2 314 aa15.67■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 SPTSSAQ969W0 71 aa15.67■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 ZNF799Q96GE5 643 aa15.67■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 WDYHV1Q96HA8 205 aa15.67■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 EMC3Q9P0I2 261 aa15.67■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 KLK11Q9UBX7 282 aa15.67■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 CIB4A0PJX0 185 aa15.66■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 IGLV3-1P01715 115 aa15.66■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 MT-ND4P03905 459 aa15.66■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 CRYGSP22914 178 aa15.66■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 SFRP5Q5T4F7 317 aa15.66■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 OR10K2Q6IF99 312 aa15.66■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 IGFL2Q6UWQ7 119 aa15.66■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 CHMP1BQ7LBR1 199 aa15.66■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 SLC16A14Q7RTX9 510 aa15.66■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 OR1F12Q8NHA8 337 aa15.66■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 SORCS2Q96PQ0 1159 aa15.66■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 GAL3ST1Q99999 423 aa15.66■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 MARVELD1Q9BSK0 173 aa15.66■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa15.66■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 DIABLOQ9NR28 239 aa15.66■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 PARPBPQ9NWS1 579 aa15.66■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 NPAP1Q9NZP6 1156 aa15.66■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 TRAV18A0A075B6X5 111 aa15.66■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 GGT3PA6NGU5 568 aa15.66■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 LDLRAD4O15165 306 aa15.66■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 PSG4Q00888 419 aa15.66■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 C9orf135Q5VTT2 229 aa15.66■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 OR5AS1Q8N127 324 aa15.66■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 SPACA5Q96QH8 159 aa15.66■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 LINC00470Q9BZP3 86 aa15.66■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 WNT5BQ9H1J7 359 aa15.66■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa15.66■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 CENPXA8MT69 81 aa15.65■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 ZNF724A8MTY0 619 aa15.65■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 YES1P07947 543 aa15.65■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 RAB25P57735 213 aa15.65■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 ARF1P84077 181 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 HGFACQ04756 655 aa15.65■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 SCRN3Q0VDG4 424 aa15.65■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 SNAI3Q3KNW1 292 aa15.65■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 OR2H1Q9GZK4 316 aa15.65■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 BCO1Q9HAY6 547 aa15.65■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa15.65■□□□□ 0.1
ACTB-201ENST00000331789 A0A0U1RQV5 110 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 EFSO43281 561 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 APOC1P02654 83 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 GIFP27352 417 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 DYRK1AQ13627 763 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 TATDN3Q17R31 274 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 PGAP1Q75T13 922 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 UBASH3BQ8TF42 649 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 SGK3Q96BR1 496 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 ALG5Q9Y673 324 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 OR6C6A6NF89 314 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 CCNKO75909 580 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 WISP2O76076 250 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 TPPPO94811 219 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 TGM6O95932 706 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 GABRA1P14867 456 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 CPN1P15169 458 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 CCR6P51684 374 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 ECH1Q13011 328 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 DMRTC1Q5HYR2 192 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 MCEMP1Q8IX19 187 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 C15orf40Q8WUR7 153 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 PHF21AQ96BD5 680 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 ITPKCQ96DU7 683 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 RNF122Q9H9V4 155 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 KCNMB2Q9Y691 235 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 V9GYS6 101 aa15.64■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 HMX3A6NHT5 357 aa15.63■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
ACTB-201ENST00000331789 HTR5AP47898 357 aa15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms