RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 KDM4DQ6B0I6 523 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 SHFQ7M4L6 423 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 OTOSQ8NHW6 89 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 MEGF10Q96KG7 1140 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 SIGLEC11Q96RL6 698 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 F5H5P2 479 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV2-70P01814 119 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 MSMBP08118 114 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 EPHA2P29317 976 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 OPRL1P41146 370 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC15A1P46059 708 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 CX3CR1P49238 355 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPS7P62081 194 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 TOR3AQ9H497 397 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 LPAR2Q9HBW0 351 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 GCM1Q9NP62 436 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM100Q9NV29 134 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPTNQ9Y639 398 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNHD1Q96M86 4753 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 ISPDA4D126 451 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC182A6NF36 153 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD300LBA8K4G0 201 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 M0R129 80 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRKYO43930 277 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 HLA-DPB1P04440 258 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSD11B1P28845 292 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACTR3P61158 418 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 APOFQ13790 326 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLX4IPQ5VYV7 408 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 RHOUQ7L0Q8 258 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRSS45Q7RTY3 260 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 GLCCI1Q86VQ1 547 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF454Q8N9F8 522 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR51F2Q8NH61 342 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 PYDC1Q8WXC3 89 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB39BQ96DA2 213 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 GAL3ST1Q99999 423 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZAR1LA6NP61 321 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 XRCC2O43543 280 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 LYNP07948 512 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 SRP9P49458 86 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 C12orf73Q69YU5 71 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPSB4Q96A44 273 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM186Q96B77 213 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 CIB1Q99828 191 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRRG3Q9BZD7 231 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 OAZ3Q9UMX2 235 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 GGT3PA6NGU5 568 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 H3BNX3 289 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBX1O43435 398 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 HNF1AP20823 631 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZMYND11Q15326 602 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR56B2PQ8NGI1 322 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 OPA3Q9H6K4 179 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIF1ANQ9NWT6 349 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 WNK2Q9Y3S1 2297 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 SAC3D1A6NKF1 404 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM178BH3BS89 294 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 APOC1P02654 83 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 H2BFMP0C1H6 154 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 SRD5A1P18405 259 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALOX5APP20292 161 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 CA6P23280 308 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD200P41217 278 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 GATA4P43694 442 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAD23AP54725 363 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 BTG1P62324 171 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 EFNB1P98172 346 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAB21L1Q13394 359 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 LCN1P1Q5VSP4 162 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM57BQ71RH2 274 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC16A9Q7RTY1 509 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 MOGAT3Q86VF5 341 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 THEM6Q8WUY1 208 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 TEAD3Q99594 435 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBAP1Q9NZ09 502 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF319Q9P2F9 582 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 ENOPH1Q9UHY7 261 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRAV20A0A0B4J274 112 aa16.45■□□□□ 0.22
PTPRCAP-201ENST00000326294 IFNL4K9M1U5 179 aa16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.5 ms