RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269740.8

SLC39A3-201, Transcript of solute carrier family 39 member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC39A3, Length 1,502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3-201ENST00000269740 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa20.53■□□□□ 0.88
SLC39A3-201ENST00000269740 E9PI62 339 aa20.52■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 OGG1O15527 345 aa20.52■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 TBX1O43435 398 aa20.52■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 ATE1O95260 518 aa20.52■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 PCMT1P22061 227 aa20.52■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 CFL1P23528 166 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 WDR38Q5JTN6 314 aa20.52■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 FBXW12Q6X9E4 464 aa20.52■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 PRSS35Q8N3Z0 413 aa20.52■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 TMEM171Q8WVE6 324 aa20.52■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 ITFG2Q969R8 447 aa20.52■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 SPSB4Q96A44 273 aa20.52■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 MAGEA13PA6NCF6 341 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 GPRIN2O60269 458 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 LALBAP00709 142 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 TTRP02766 147 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 RPSAP08865 295 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 THBS4P35443 961 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 ZNF718Q3SXZ3 478 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 ZNF367Q7RTV3 350 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 SLC25A40Q8TBP6 338 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 RPS4Y2Q8TD47 263 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 SGK3Q96BR1 496 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 OR2J1Q9GZK6 312 aa20.51■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 TRIM64CA6NLI5 447 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 E7EQL1 145 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 ZNF250P15622 560 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 TLE4Q04727 773 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 CDK5R1Q15078 307 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 TIGD6Q17RP2 521 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 UBE2UQ5VVX9 321 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 SLC22A13Q9Y226 551 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 CMAHPQ9Y471 501 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 C5orf63A6NC05 138 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 TMEM212A6NML5 194 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 OR4C45A6NMZ5 311 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 IGLV3-1P01715 115 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 ISG15P05161 165 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 RAC2P15153 192 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 ANOS1P23352 680 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 GCH1P30793 250 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 KIR3DL2P43630 455 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 ERVS71-1P61550 626 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 GLYATL3Q5SZD4 288 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 XAF1Q6GPH4 301 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 PPP1R14AQ96A00 147 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 MGLLQ99685 303 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 DHRS9Q9BPW9 319 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 VCX3AQ9NNX9 186 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 ZNF92Q03936 586 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 GPR50Q13585 617 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 OR2AE1Q8NHA4 323 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 FBXW5Q969U6 566 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 SMIM19Q96E16 107 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 REEP6Q96HR9 211 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 PTTG3PQ9NZH4 202 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 CENPEQ02224 2701 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 HS3ST1O14792 307 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 PLPP2O43688 288 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 CD1AP06126 327 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 FABP6P51161 128 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 SELENOVP59797 346 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 DOC2BQ14184 412 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 ADIPOQQ15848 244 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 SPATA46Q5T0L3 261 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 TMEM244Q5VVB8 128 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 VHLLQ6RSH7 139 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 KCTD8Q6ZWB6 473 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 PGAP1Q75T13 922 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 OR5AK2Q8NH90 309 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 SYNPRQ8TBG9 265 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 OR51E1Q8TCB6 317 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 NEUROG1Q92886 237 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 HAVCR1Q96D42 359 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 COMMD4Q9H0A8 199 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC39A3-201ENST00000269740 POFUT1Q9H488 388 aa20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms