RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 MYO18BQ8IUG5 2567 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 TO15178 435 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 MAS1P04201 325 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 ALOX5APP20292 161 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 AQP2P41181 271 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 DNASE1L1P49184 302 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 CENPAP49450 140 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 TAS2R19P59542 299 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 CTXN1P60606 82 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 C11orf88Q6PI97 169 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC6A15Q9H2J7 730 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 EXO5Q9H790 373 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 IKZF2Q9UKS7 526 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 OR10H1Q9Y4A9 318 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF407Q9C0G0 2248 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC17A2O00624 439 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB11BQ15907 218 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 KLHL26Q53HC5 615 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 OR7E24Q6IFN5 339 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 STEAP1BQ6NZ63 245 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 STPG2Q8N412 459 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM229BQ8NBD8 167 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM178AQ8NBL3 297 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 PAQR8Q8TEZ7 354 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 SGCZQ96LD1 299 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 FLNCQ14315 2725 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 C17orf51A8MQB3 221 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 ASAH2BP0C7U1 165 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 MEOX1P50221 254 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 BCORP1Q8N888 145 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 OR51S1Q8NGJ8 323 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 GPX8Q8TED1 209 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 ASB17Q8WXJ9 295 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 FREM3P0C091 2139 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 COL12A1Q99715 3063 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0A6YYH2 397 aa23.33■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 C2orf72A6NCS6 295 aa23.33■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 A6NJ64 397 aa23.33■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 TSPAN2O60636 221 aa23.33■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 CD8AP01732 235 aa23.33■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF345Q14585 488 aa23.33■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 C4orf46Q504U0 113 aa23.33■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa23.33■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 PXT1Q8NFP0 134 aa23.33■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 C4orf45Q96LM5 186 aa23.33■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 INTS14Q96SY0 518 aa23.33■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 NCKAP5O14513 1909 aa23.33■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 WNT11O96014 354 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 MST1P26927 711 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 C10orf53Q8N6V4 93 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5T2Q8NGG2 359 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 PHYHIPLQ96FC7 376 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 HRH3Q9Y5N1 445 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAJC13O75165 2243 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAV18A0A075B6X5 111 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM171A2A8MVW0 826 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNHIT1O43257 154 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 SIX6O95475 246 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 NAT1P18440 290 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 POU3F4P49335 361 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 C2orf68Q2NKX9 166 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2M7Q8NG81 312 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 OR52H1Q8NGJ2 320 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM3DQ96BQ1 224 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM17Q86X19 198 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 OR51D1Q8NGF3 324 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4C3Q8NH37 302 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 MED12Q93074 2177 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 PCNX3Q9H6A9 2034 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 TENM4Q6N022 2769 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 P04436 131 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 GXYLT1Q4G148 440 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 DCAF12L2Q5VW00 463 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM166AQ6J272 317 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC36Q8IYA8 594 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 GABRG1Q8N1C3 465 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 OR6N2Q8NGY6 317 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 MPTX1A8MV57 137 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2F2O95006 317 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 CNR1P21554 472 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 PTGDSP41222 190 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 CAPZA1P52907 286 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXO1Q12778 655 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2F1Q13607 317 aa23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms