RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000054666.10

VAMP3-201, Transcript of vesicle associated membrane protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP3, Length 2,205 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3-201ENST00000054666 OR4D10Q8NGI6 311 aa7.29□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 CCDC107Q8WV48 283 aa7.29□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa7.29□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 SPTSSAQ969W0 71 aa7.29□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 SEH1LQ96EE3 360 aa7.29□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 MS4A3Q96HJ5 214 aa7.29□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 GPER1Q99527 375 aa7.29□□□□□ -1.24
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VAMP3-201ENST00000054666 COL6A3P12111 3177 aa7.29□□□□□ -1.24
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VAMP3-201ENST00000054666 A6NL46 340 aa7.29□□□□□ -1.24
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VAMP3-201ENST00000054666 AMY2AP04746 511 aa7.29□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 GIPP09681 153 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 ABOP16442 354 aa7.29□□□□□ -1.24
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VAMP3-201ENST00000054666 CARD18P57730 90 aa7.29□□□□□ -1.24
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VAMP3-201ENST00000054666 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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VAMP3-201ENST00000054666 H3F3CQ6NXT2 135 aa7.29□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF529Q6P280 563 aa7.29□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 OR2W3Q7Z3T1 314 aa7.29□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 LRRC18Q8N456 261 aa7.29□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 OR2V1Q8NHB1 315 aa7.29□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
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VAMP3-201ENST00000054666 IFT46Q9NQC8 304 aa7.29□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
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VAMP3-201ENST00000054666 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
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VAMP3-201ENST00000054666 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa7.29□□□□□ -1.24
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VAMP3-201ENST00000054666 C21orf140B9A014 251 aa7.28□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 DISC1C4P0D8 188 aa7.28□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 C9orf172C9J069 976 aa7.28□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 F5H5K5 113 aa7.28□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 M0R135 149 aa7.28□□□□□ -1.24
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VAMP3-201ENST00000054666 VSIG8P0DPA2 414 aa7.28□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 CTSSP25774 331 aa7.28□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 DLSTP36957 453 aa7.28□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 HTR2BP41595 481 aa7.28□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 GSK3AP49840 483 aa7.28□□□□□ -1.24
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VAMP3-201ENST00000054666 B3GALT5-AS1P59052 145 aa7.28□□□□□ -1.24
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VAMP3-201ENST00000054666 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa7.28□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 ANGPTL5Q86XS5 388 aa7.28□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 C20orf196Q8IYI0 205 aa7.28□□□□□ -1.24
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VAMP3-201ENST00000054666 ZNF799Q96GE5 643 aa7.28□□□□□ -1.24
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VAMP3-201ENST00000054666 GPR87Q9BY21 358 aa7.28□□□□□ -1.24
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VAMP3-201ENST00000054666 LRFN1Q9P244 771 aa7.28□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 B4GALT7Q9UBV7 327 aa7.28□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 FBLN5Q9UBX5 448 aa7.28□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 KLK13Q9UKR3 277 aa7.28□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 A0A0U1RQV5 110 aa7.28□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 TMEM82A0PJX8 343 aa7.28□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 PMS2P1A4D2B8 440 aa7.28□□□□□ -1.24
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VAMP3-201ENST00000054666 CHRM2P08172 466 aa7.28□□□□□ -1.24
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VAMP3-201ENST00000054666 ZNF81P51508 661 aa7.28□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 TSPAN5P62079 268 aa7.28□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 ZMYND11Q15326 602 aa7.28□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 C11orf88Q6PI97 169 aa7.28□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa7.28□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.28□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 FJX1Q86VR8 437 aa7.28□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 GPR137CQ8N3F9 429 aa7.28□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 GALNT16Q8N428 558 aa7.28□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 FAM109AQ8N4B1 249 aa7.28□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 BPIFB2Q8N4F0 458 aa7.28□□□□□ -1.24
VAMP3-201ENST00000054666 OR8H1Q8NGG4 311 aa7.28□□□□□ -1.24
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