RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006275.8

TRAPPC6A-201, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 805 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TSTQ16762 297 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 PKP2Q99959 881 aa16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-201ENST00000006275 COPS4Q9BT78 406 aa16.02■□□□□ 0.16
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 ESM1Q9NQ30 184 aa16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CENPMQ9NSP4 180 aa16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DECR2Q9NUI1 292 aa16.02■□□□□ 0.16
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 TREML4Q6UXN2 200 aa16.01■□□□□ 0.15
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 OR5AS1Q8N127 324 aa15.99■□□□□ 0.15
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 PLPP2O43688 288 aa15.97■□□□□ 0.15
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 SELEP16581 610 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TNFSF4P23510 183 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HSD11B1P28845 292 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CRYBB2P43320 205 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CDK5R2Q13319 367 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LCN1P1Q5VSP4 162 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TCEANCQ8N8B7 351 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 OR2Z1Q8NG97 314 aa15.97■□□□□ 0.15
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