RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637686.1

CLN3-261, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5

Gene CLN3, Length 533 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-261ENST00000637686 ALG8Q9BVK2 526 aa8.51□□□□□ -1.05
CLN3-261ENST00000637686 ZNF416Q9BWM5 594 aa8.51□□□□□ -1.05
CLN3-261ENST00000637686 GSX2Q9BZM3 304 aa8.51□□□□□ -1.05
CLN3-261ENST00000637686 WNT5BQ9H1J7 359 aa8.51□□□□□ -1.05
CLN3-261ENST00000637686 C1orf198Q9H425 327 aa8.51□□□□□ -1.05
CLN3-261ENST00000637686 NIPAL2Q9H841 368 aa8.51□□□□□ -1.05
CLN3-261ENST00000637686 NDUFA13Q9P0J0 144 aa8.51□□□□□ -1.05
CLN3-261ENST00000637686 LAMP5Q9UJQ1 280 aa8.51□□□□□ -1.05
CLN3-261ENST00000637686 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa8.51□□□□□ -1.05
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CLN3-261ENST00000637686 CCNOP22674 350 aa8.5□□□□□ -1.05
CLN3-261ENST00000637686 STOMP27105 288 aa8.5□□□□□ -1.05
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CLN3-261ENST00000637686 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
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CLN3-261ENST00000637686 ETV1P50549 477 aa8.5□□□□□ -1.05
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CLN3-261ENST00000637686 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
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CLN3-261ENST00000637686 TBC1D28Q2M2D7 210 aa8.5□□□□□ -1.05
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CLN3-261ENST00000637686 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
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CLN3-261ENST00000637686 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
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CLN3-261ENST00000637686 LOC100509620A0A075B734 347 aa8.48□□□□□ -1.05
CLN3-261ENST00000637686 C5orf49A4QMS7 147 aa8.48□□□□□ -1.05
CLN3-261ENST00000637686 B9A039 149 aa8.48□□□□□ -1.05
CLN3-261ENST00000637686 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
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